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Enregistrement W4389034132 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.1205.10

Regulation of Fibronectin Gene Expression by Scleraxis

2016· article· en· W4389034132 sur OpenAlexafffundabout
Michael P. Czubryt, Justin J. Lin, Rushita A. Bagchi, Ryan Wang

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Fibrosis and Remodeling
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFibronectinChromatin immunoprecipitationCell biologyTransactivationTranscription factorBiologyMolecular biologyRegulation of gene expressionGene expressionReporter geneLuciferaseTranscriptional regulationPromoterExtracellular matrixGeneTransfectionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The glycoprotein fibronectin is a key component of the extracellular matrix (ECM), linking myriad ECM components such as collagen to one another as well as to cell surface integrins and contributing to basal tissue structure. Up‐regulation of fibronectin occurs in response to injury, and increased fibronectin expression is an important feature of pathological cardiac fibrosis, however the molecular regulators of this process are incompletely defined. We previously found that the transcription factor scleraxis regulates the expression of numerous ECM components, and that scleraxis is up‐regulated by pro‐fibrotic stimuli, thus our objective was to determine the effect of scleraxis on fibronectin expression. Transfection of NIH‐3T3 fibroblasts with scleraxis resulted in a three‐fold increase in fibronectin gene expression. In silico analysis of the human fibronectin gene promoter sequence revealed two putative E‐box sequences to which scleraxis may bind. Using chromatin immunoprecipitation assays, we confirmed the occupancy of these sites by scleraxis in human cardiac myofibroblasts, and demonstrated the ability of scleraxis to bind these E‐boxes using electrophoretic mobility shift assays. By luciferase gene reporter experiments, we found that scleraxis transactivates the fibronectin gene promoter. Site‐directed mutagenesis of single E‐boxes significantly reduced promoter transactivation, with complete abrogation of scleraxis‐mediated reporter activity when both E‐boxes were mutated. Our data demonstrates that scleraxis is a potent transcriptional regulator of fibronectin gene expression, reveals the mechanism by which this regulation is achieved, and suggests that scleraxis‐mediated fibronectin expression may contribute to fibrosis. Support or Funding Information Supported by the Canadian Institutes of Health Research (MOP‐136862 to MPC).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,206

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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