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Enregistrement W4389069183 · doi:10.3767/persoonia.2023.51.06

High species diversity in <i>Diaporthe</i> associated with citrus diseases in China

2023· article· en· W4389069183 sur OpenAlexaff
Xun Xiao, Y.D. Liu, Fang Zheng, Tao Xiong, Ying Zeng, W. Wang, Xiaolin Zheng, Quan‐Xiang Wu, Juping Xu, P.W. Crous, H.Y. Li

Notice bibliographique

RevuePersoonia - Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyChinaDiversity (politics)BotanyArchaeologyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Species in Diaporthe have broad host ranges and cosmopolitan geographic distributions, occurring as endophytes, saprobes and plantpathogens. Previous studies have indicated that many Diaporthe species are associated with Citrus . To further determine the diversity of Diaporthe species associated with citrus diseases in China, we conducted extensive surveys in major citrus-producing are as from 2017–2020. Diseased tissues we recollected from leaves, fruits, twigs, branches and trunks showing a range of symptoms including melanose, dieback, gummosis, wood decay and canker. Based on phylogenetic comparisons of DNA sequences of the internal transcribed spacer regions(ITS), calmodulin( cal ), histoneH3( his3 ), translation elongation factor1-alpha ( tef1 ) and beta-tubulin ( tub2 ), 393 isolates from 10 provinces were identified as belonging to 36 species of Diaporthe , including 32 known species, namely D. apiculata , D. biconispora , D. biguttulata , D. caryae , D. citri , D. citriasiana , D. compacta , D. discoidispora , D. endophytica , D. eres , D. fusicola , D. fulvicolor , D. guangxiensis , D. hongkongensis , D. hubeiensis , D. limonicola , D. litchii , D. novem , D. passifloricola , D. penetriteum , D. pescicola , D. pometiae , D. sackstonii , D. sennicola , D. sojae , D. spinosa , D. subclavata , D. tectonae , D. tibetensis , D. unshiuensis , D. velutina and D. xishuangbanica , and four new species, namely D. gammata , D. jishouensis , D. ruiliensis and D. sexualispora . Among the 32 known species, 14 are reported for the first time on Citrus , and two are newly reported from China. Among the 36 species, D. citri was the dominant species as exemplified by its high frequency of isolationand virulence. Pathogenicity tests indicated that most Diaporthe species obtained in this study were weakly aggressive or non-pathogenic to the tested citrus varieties. Only D. citri produced the longest lesion lengths on citrus shoots and induced melanose on citrus leaves. These results further demonstrated that a rich diversity of Diaporthe species occupy Citrus , but only a few species are harmful and D. citri is the main pathogen for Citrus in China. The present study provides a basis from which targeted monitoring, prevention and control measures can be developed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,422
Score d'incertitude au seuil0,631

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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