Effect of Phosphothioate Modification on the Anti-L-Tyrosinamide Aptamer
Notice bibliographique
Résumé
Aptamers are short, single-stranded RNA or DNA molecules that can bind to targets with high affinity and selectivity.Aptamers are versatile for their flexibility to be chemically modified, which can increase their stability against nucleases and positively affect their binding affinities.Many chemical modifications can be applied to aptamers, however for this study, phosphothioate modification (PS) is of interest.In antisense oligonucleotides, PS modifications seem to enhance the oligonucleotide's stability and resistance to nuclease degradation.To our knowledge, there were no studies documenting the effect of PS modification on aptamers, specifically anti-L-Tyrosinamide aptamers.Thus, the aim of this study is to understand the effect PS modifications have on aptamer binding and recognition to the target, L-Tyrosinamide, to exploit the modification to make an assay that is innovative and universally adaptable for small molecule KD determination.In this study, BSA yielded the best assay design using fluorescence anisotropy, at a concentration of 1.5x10 -7 M with an LOD of 3.04 µM and a spike recovery of 95.5% in urine.The findings of this study, mentioned above, will not only shed light on the effects of PS modifications on anti-L-Tyrosinamide aptamer, but possibly on other aptamers in general.Understanding the potential impact of the phosphothioate modification on the aptamer's functionality can contribute to valuable insights into the potential applications of aptamers and their optimization for various biomedical and biotechnological applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».