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Enregistrement W4389241602 · doi:10.1158/2326-6074.tumimm23-pr06

Abstract PR06: Hallmarks of CD8 T cell dysfunction are established within hours of tumor antigen encounter prior to cell division

2023· article· en· W4389241602 sur OpenAlexaboutno aff
Mary Philip, Michael Rudloff, Paul Zumbo, Doron Betel, Natalie R. Favret, Jessica J. Roetman, Carlos R. Detrés Román, Megan M. Erwin, Kristen A. Murray, Sriya Jonnakuti, Friederike Dündar

Notice bibliographique

RevueCancer Immunology Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTumor microenvironmentImmunologyT cellCD8Cytotoxic T cellEpigeneticsImmunotherapyCancerBiologyCancer researchCancer immunotherapyAntigenContext (archaeology)MedicineImmune systemGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Tumor-specific CD8 T cells (TST) found in patients with cancer are dysfunctional and unable to halt cancer progressions. TST dysfunction, also known as T cell exhaustion, is thought to be driven by chronic T cell receptor/antigen stimulation and immunosuppressive factors within the tumor microenvironment. However, we know little about the interplay between CD8 T cell function, cell division, and epigenetic remodeling during the first hours following activation and tumor encounter. Here, we assessed TST differentiation, cell division, chromatin accessibility, and transcription in two clinically-relevant cancer mouse models (autochthonous liver cancer and metastatic melanoma), and we compared TST fate trajectories to those of CD8 T cells differentiating during acute infection. Surprisingly, despite robust activation and proliferation, TST had near complete effector function impairment even prior to undergoing cell division, and had acquired hallmark chromatin accessibility features previously observed in late dysfunctional/exhausted T cells. Moreover, continued tumor/antigen exposure drove progressive epigenetic remodeling, “imprinting” the dysfunctional state. Our study defines for the first time the regulation and kinetics underlying T cell fate choice prior to cell division in the context of tumors versus infection. Citation Format: Mary Philip, Michael W. Rudloff, Paul Zumbo, Doron Betel, Natalie R. Favret, Jessica J. Roetman, Carlos R. Detres Roman, Megan M. Erwin, Kristen A. Murray, Sriya T. Jonnakuti, Friederike Dundar. Hallmarks of CD8 T cell dysfunction are established within hours of tumor antigen encounter prior to cell division [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Tumor Immunology and Immunotherapy; 2023 Oct 1-4; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Immunol Res 2023;11(12 Suppl):Abstract nr PR06.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,431
Score d'incertitude au seuil0,922

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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