MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4389241633 · doi:10.1158/1535-7163.targ-23-c082

Abstract C082: SCD1 is a potent therapeutic target in MYC-amplified group 3 medulloblastoma

2023· article· en· W4389241633 sur OpenAlexaff
Stefan Custers, Laura Escudero, Yujin Suk, Dillon McKenna, William D. Gwynne, Iqra Chaudhry, Jeremy Chan, Andrew T. Quaile, Jason Moffat, Chitra Venugopal, J. Rafael Montenegro-Burke, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaIn vivoBiologyLipid metabolismCancer researchWnt signaling pathwayTranscriptomeEnzymeIn vitroChemistryBiochemistryGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Medulloblastoma (MB) is the most common pediatric brain tumor comprising of four subgroups: WNT, SHH, Group 3 (Gp3) and Group 4 (G4). Improved Standard of care has led to a greatly improved patient survival. However, 30% of patients still succumb to the disease and survivors are plagued with lifelong neuro-cognitive and neuro-developmental disorders. MYC amplified G3MB is a highly aggressive subgroup with a high frequency of metastasis and recurrence, leading to a bleak prognosis. Molecular understanding of G3MB is lacking and improved treatment options are urgently needed. Recent studies suggest a role for reprogrammed lipid metabolism, especially at recurrence. Here, we utilized comparative profiling of the G3MB and neural stem cells (NSC) lipidome with liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS). We identified a class of lipids whose differential abundance in G3MB renders these tumor cells sensitive to chemical inhibition of their biosynthesis. Pharmacological and genetic inhibition of the rate limiting enzyme of the de novo lipid synthesis pathway, Stearoyl-CoA Desaturase-1 (SCD1), completely abolishes self-renewal and proliferation in vitro, while supplementing cell culturing media with Oleic Acid (OA) fully restores these effects. Genetic knockout of SCD1 in G3MB cells significantly prolongs survival and reduced tumor burden in vivo. Moreover, administration of CAY10566, a SCD1 specific small molecule inhibitor significantly prolongs survival in vivo as well. RNA-seq, lipidomic and metabolomic analyses of G3MB treated with CAY10566 or DMSO is being employed to unravel SCD1-mediated mechanisms. Together, these data suggest that enzymes regulating lipid metabolism in G3MB represent potential targets for therapeutic translation. Citation Format: Stefan Custers, Laura Escudero, Yujin Suk, Dillon McKenna, William Gwynne, Iqra Chaudhry, Jeremy Chan, Andrew Quaile, Jason Moffat, Chitra Venugopal, Rafael Montenegro-Burke, Sheila Singh. SCD1 is a potent therapeutic target in MYC-amplified group 3 medulloblastoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR-NCI-EORTC Virtual International Conference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics; 2023 Oct 11-15; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2023;22(12 Suppl):Abstract nr C082.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Cancer TherapeuticsMême sujetCancer, Lipids, and MetabolismTravaux en français237 207