MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4389280326 · doi:10.1016/j.celrep.2023.113551

Single-cell RNA sequencing uncovers the cell type-dependent transcriptomic changes in the retrosplenial cortex after peripheral nerve injury

2023· article· en· W4389280326 sur OpenAlexaff
Jinghua Wang, Cheng Wu, Yan‐Na Lian, Xiaowen Cao, Ziyue Wang, Jiajun Dong, Qin Wu, Li Liu, Li Sun, Wei Chen, Wenjuan Chen, Zhang Zhi, Min Zhuo, Xiang‐Yao Li

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesWuhan University School of MedicineNational Natural Science Foundation of ChinaNational University's Basic Research Foundation of ChinaZhejiang UniversityMinistry of Education - Singapore
Mots-clésRetrosplenial cortexChromatin structure remodeling (RSC) complexNeuropathic painNeurosciencePeripheral nerve injuryTranscriptomeNerve injuryExcitatory postsynaptic potentialNucleusChemistryMedicineBiologyAnesthesiaCortex (anatomy)Inhibitory postsynaptic potentialTranscription factorBiochemistryGeneGene expressionSciatic nerve

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The retrosplenial cortex (RSC) is a vital area for storing remote memory and has recently been found to undergo broad changes after peripheral nerve injury. However, little is known about the role of RSC in pain regulation. Here, we examine the involvement of RSC in the pain of mice with nerve injury. Notably, reducing the activities of calcium-/calmodulin-dependent protein kinase type II-positive splenial neurons chemogenetically increases paw withdrawal threshold and extends thermal withdrawal latency in mice with nerve injury. The single-cell or single-nucleus RNA-sequencing results predict enhanced excitatory synaptic transmissions in RSC induced by nerve injury. Local infusion of 1-naphthyl acetyl spermine into RSC to decrease the excitatory synaptic transmissions relieves pain and induces conditioned place preference. Our data indicate that RSC is critical for regulating physiological and neuropathic pain. The cell type-dependent transcriptomic information would help understand the molecular basis of neuropathic pain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,722

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCell ReportsMême sujetNeuroinflammation and Neurodegeneration MechanismsTravaux en français237 207