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Enregistrement W4389410269 · doi:10.1101/2023.12.04.569987

Diversity of Insecticidal PA1b Homologs among Legume Seeds from Middle Eastern Region

2023· preprint· en· W4389410269 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'EnvironnementInstitut National des Sciences Appliquées de LyonUniversité LibanaiseAgence Universitaire de la FrancophonieIndian National Science Academy
Mots-clésFabaceaeBiologyLegumeSubfamilyPhylogenetic treePisumSativumStorage proteinGenePhylogeneticsEvolutionary biologyBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Legumes play a central role in various food systems, with significant socio-economic and environmental impacts. Their high protein content, composed mainly of globulins and albumins, makes them valuable for human food and animal feed. Among the albumins, is Pea Albumin 1 b (PA1b), a 37 amino acid peptide, extracted from the seeds of the pea Pisum sativum . The protein displays the knottin scaffold and exhibits potent insecticidal activity against certain insects including cereal weevils and mosquitoes. This toxicity is attributed to the coexistence of several isoforms in peas. The natural diversity of PA1b-like molecules within the legume species of the Fabaceae family has been studied using various molecular, biochemical, and bioinformatic tools. Several A1 genes coding for this peptide have been characterized in soybeans, bean, barrel medick and other legume species. The aim of is study is to precisely characterize partial A1 genes in legumes of the Faboideae subfamily from the Middle East region using PCR homology. Specifically, the research focuses on the sequence structure of Pea Albumin 1 b (PA1b) variants and establishes phylogenetic relationships between these sequences and publicly available A1b homologs. The toxic effects of seed flour containing PA1b-like molecules are assessed, demonstrating that the newly characterized PA1b homologs retain structural conservation. The study observes both conservation and diversification among A1b homologs, consistent with the divergence of lineages within the Fabaceae family. The toxic effects associated with putative A1b molecules are found across different species and within the same species from different geographical origins. In particular, novel candidates such as Vicia sativa and Medicago minima show promising insecticidal A1b activity. Further analysis of isoforms from these species, including an examination of their expression in different tissues and organs should be undertaken to facilitate the potential use of A1b molecules in agricultural practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,238
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle