Hydrogen Sulfide Producers Drive a Diarrhea-Like Phenotype and a Methane Producer Drives a Constipation-Like Phenotype in Animal Models
Notice bibliographique
Résumé
We recently demonstrated that diarrhea-predominant irritable bowel syndrome (IBS-D) subjects have higher relative abundance (RA) of hydrogen sulfide (H 2 S)-producing Fusobacterium and Desulfovibrio species, and constipation-predominant IBS (IBS-C) subjects have higher RA of methanogen Methanobrevibacter smithii . In this study, we investigate the effects of increased methanogens or H 2 S producers on stool phenotypes in rat models. Adult Sprague–Dawley rats were fed high-fat diet (HFD) for 60 days to increase M. smithii levels, then gavaged for 10 days with water (controls) or methanogenesis inhibitors. To increase H 2 S producers, rats were gavaged with F. varium or D. piger . Stool consistency (stool wet weight (SWW)) and gas production were measured. 16S rRNA gene sequencing was performed on stool samples. In HFD diet-fed rats ( N = 30), stool M. smithii levels were increased ( P < 0.001) after 52 days, correlating with significantly decreased SWW ( P < 0.0001) at 59 days ( R = − 0.38, P = 0.037). Small bowel M. smithii levels decreased significantly in lovastatin lactone-treated rats ( P < 0.0006), and SWW increased (normalized) in lovastatin hydroxyacid-treated rats ( P = 0.0246), vs. controls ( N = 10/group). SWW increased significantly in D. piger -gavaged rats ( N = 16) on day 10 ( P < 0.0001), and in F. varium -gavaged rats ( N = 16) at all timepoints, vs. controls, with increased stool H 2 S production. 16S sequencing revealed stool microbiota alterations in rats gavaged with H 2 S producers, with higher relative abundance (RA) of other H 2 S producers, particularly Lachnospiraceae and Bilophila in F. varium -gavaged rats, and Sutterella in D. piger -gavaged rats. These findings suggest that increased M. smithii levels result in a constipation-like phenotype in a rat model that is partly reversible with methanogenesis inhibitors, whereas gavage with H 2 S producers D. piger or F. varium results in increased colonization with other H 2 S producers and diarrhea-like phenotypes. This supports roles for the increased RA of methanogens and H 2 S producers identified in IBS-C and IBS-D subjects, respectively, in contributing to stool phenotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».