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Enregistrement W4389799723 · doi:10.1101/pdb.prot108282

Examining Apical or Basolateral Protein Localization in<i>Aedes aegypti</i>Tissues: Cross-Section Immunohistochemistry

2023· article· en· W4389799723 sur OpenAlexaff
Farwa Sajadi, Britney Picinic, Salwa Afifi, Jean‐Paul Paluzzi

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Protocols · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryPrimary and secondary antibodiesAntibodyBiologyStainingEpitopeMolecular biologyBlotPathologyBiochemistryImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immunohistochemistry (IHC) is an important technique that permits visualization of cellular components and for determining the presence and/or distribution of proteins or other macromolecules in tissue samples. Normally, IHC involves the detection of epitopes using an antigen-specific primary antibody and a secondary antibody coupled with a reporter molecule or fluorophore that can bind to the primary antibody, allowing for the spatial distribution of a protein of interest to be detected. Although normally IHC does not provide quantitative results compared to techniques such as enzyme-linked immunoassay or western blotting, it permits the localization, expression mapping, and distribution of target proteins in intact tissues. Here, we describe an IHC protocol for examining apical versus basolateral protein staining through sectioning tissue samples from fixed, embedded tissues (e.g., IHC-paraffin) and adding primary antibodies against a target protein. This IHC protocol provides a guide for tissue fixation, sectioning, and staining of tissue samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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