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Enregistrement W4389985347 · doi:10.1101/2023.12.19.572366

A functional perspective on the conditional covariance comparison problem in dementia analysis

2023· preprint· en· W4389985347 sur OpenAlexfundno aff
Calvin Guan, Ashis Gangopadhyay

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueBayesian Methods and Mixture Models
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen Alzheimer Immunotherapy Research And DevelopmentJohnson and Johnson Pharmaceutical Research and DevelopmentJanssen Research and DevelopmentNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchMeso Scale DiagnosticsJohnson and JohnsonNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiPfizerBioClinicaBiogenEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbF. Hoffmann-La RocheAlzheimer's Drug Discovery FoundationMerckNational Institute on AgingAlzheimer's Association
Mots-clésPerspective (graphical)CovarianceDementiaPsychologyEconometricsCognitive psychologyMathematicsComputer scienceStatisticsArtificial intelligenceMedicineInternal medicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although there are many methods available in the literature to compare the covariance structures of two populations, few are suitable for clinical application due to the inability to account for covariate(s) that affect the dependence structure of the variables being investigated. A common method is to adjust the effect of the covariates via a linear model and work with the resulting residuals. However, removing the effects of the covariates could potentially eliminate valuable information from the analysis. We propose a functional nonparametric covariance matrix estimator to account for any given value in the covariate(s), which allows a comparison of the functional covariance structures of the multivariate data. This comparison is facilitated via a test statistic involving the first eigenvalue of the combined form of covariance matrices of the two groups. Three different approaches, namely, the parametric Tracy-Widom, the semi-parametric Forkman’s test, and the nonparametric Permutation method, are used to compute the approximate p-values of the test statistic. We have conducted extensive simulation studies to determine the type I error and power of the proposed hypothesis testing methods and developed practical recommendations for implementing this novel approach. Finally, we apply our methods to the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) study to compare cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers between dementia and non-dementia cohorts, which offers a fascinating insight into the differences between covariance structures of biomarkers amyloid β (1-42) (A β 42), total tau (tau), and phosphorylated tau (ptau) for given values of age, sex, and years of education.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,080
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,183
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,422

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0800,183
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0020,009
Communication savante0,0040,007
Science ouverte0,0060,006
Intégrité de la recherche0,0050,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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