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Enregistrement W4390035530 · doi:10.3390/ijns10010001

Droplet Digital PCR (ddPCR) Does Not Enhance the Sensitivity of Detection of Cytomegalovirus (CMV) DNA in Newborn Dried Blood Spots Evaluated in the Context of Newborn Congenital CMV (cCMV) Screening

2023· article· en· W4390035530 sur OpenAlexaboutno aff
Nelmary Hernandez-Alvarado, Craig J. Bierle, Mark R. Schleiss

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Neonatal Screening · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of MinnesotaCenters for Disease Control and PreventionMinnesota Department of Health
Mots-clésDigital polymerase chain reactionMultiplexDried bloodCytomegalovirusMedicineContext (archaeology)Real-time polymerase chain reactionPrimer (cosmetics)Newborn screeningMultiplex polymerase chain reactionVirologyDried blood spotPolymerase chain reactionPediatricsBiologyBioinformaticsGeneticsVirusChemistryHerpesviridaeChromatographyViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital cytomegalovirus (cCMV) infection is a leading cause of sensorineural hearing loss (SNHL) and neurodevelopmental disabilities in children worldwide. Some regions in the United States and Canada have implemented universal newborn screening for cCMV, which requires molecular diagnostic technologies for identifying cCMV, such as PCR testing of newborn dried blood spots (DBS). This study aimed to evaluate the sensitivity of droplet digital PCR (ddPCR) compared to quantitative real-time PCR to detect CMV DNA in newborn DBS. The limit of detection of various ddPCR primer/probe combinations (singleplex UL55-HEX, singleplex UL83-FAM, and multiplex UL55-HEX/UL83-FAM) was evaluated using the National Institute of Standards and Technology's (NIST) CMV quantitative standard. Singleplex UL55-HEX ddPCR exhibited the lowest limit of detection among the primer/probe combinations tested for ddPCR. UL55 ddPCR was then compared to real-time PCR in 49 infants with confirmed cCMV identified through newborn screening for CMV in saliva swabs and confirmed by a urine test. The results showed that ddPCR was only positive for 59% (29 out of 49) of the cCMV infants, while real-time PCR was positive for 80% (39 out of 49). Due to its lower sensitivity and throughput, ddPCR may not be suitable for cCMV newborn screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,537
Score d'incertitude au seuil0,653

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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