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Enregistrement W4390046443 · doi:10.1073/pnas.2306863120

Identification of a muropeptide precursor transporter from gut microbiota and its role in preventing intestinal inflammation

2023· article· en· W4390046443 sur OpenAlexaff
Sophie Liuu, Malgorzata Nepelska, Hélène B. Pfister, João G. Magalhães, Grégoire Chevalier, Francesco Strozzi, Coline Billerey, Marc Maresca, Cendrine Nicoletti, Eric Di Pasquale, Charlie Pechard, Laureen Bardouillet, Stephen E. Girardin, Ivo G. Boneca, Joël Doré, Hervé M. Blottière, Christophe Bonny, Laurent Chêne, Antonietta Cultrone

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesInstitut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement
Mots-clésPeptidoglycanBiologyATP-binding cassette transporterImmune systemSecretionMicrobiologyIntestinal mucosaInflammationTransporterCell biologyBiochemistryImmunologyEnzymeGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The gut microbiota is a considerable source of biologically active compounds that can promote intestinal homeostasis and improve immune responses. Here, we used large expression libraries of cloned metagenomic DNA to identify compounds able to sustain an anti-inflammatory reaction on host cells. Starting with a screen for NF-κB activation, we have identified overlapping clones harbouring a heterodimeric ATP-binding cassette (ABC)-transporter from a Firmicutes. Extensive purification of the clone's supernatant demonstrates that the ABC-transporter allows for the efficient extracellular accumulation of three muropeptide precursor, with anti-inflammatory properties. They induce IL-10 secretion from human monocyte-derived dendritic cells and proved effective in reducing AIEC LF82 epithelial damage and IL-8 secretion in human intestinal resections. In addition, treatment with supernatants containing the muropeptide precursor reduces body weight loss and improves histological parameters in Dextran Sulfate Sodium (DSS)-treated mice. Until now, the source of peptidoglycan fragments was shown to come from the natural turnover of the peptidoglycan layer by endogenous peptidoglycan hydrolases. This is a report showing an ABC-transporter as a natural source of secreted muropeptide precursor and as an indirect player in epithelial barrier strengthening. The mechanism described here might represent an important component of the host immune homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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