Unique CSF lipid signature in asymptomatic subjects with a parental history of Alzheimer’s disease and its association with key apolipoprotein species
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background CSF apolipoproteins exhibit lipid‐specific relationships (signatures) with Alzheimer’s disease (AD) pathological markers and APOE‐ε4 in asymptomatic individuals. Method Mass spectrometry‐based CSF lipid analysis was performed as described before (Sampaio et al. 2011). Lipids were extracted using a one‐step chloroform/methanol procedure. After extraction, resulting samples were analyzed by direct infusion on a QExactive mass spectrometer equipped with a TriVersa NanoMate ion source. Both MS and MSMS data were combined to monitor CE, DAG and TAG ions as ammonium adducts; PC, PC O‐, as acetate adducts; and CL, PA, PE, PE O‐, PG and PI as deprotonated anions. CSF levels of amyloid beta (Aβ42), and total Tau (t‐Tau) were measured by enzyme‐linked immunosorbent assay (Fujirebio, Sweden) whereas apolipoproteins (AI, AII, B, CI, CII, CIII, D, E and J) concentrations were assessed using the Luminex/Biorad assays kit (10‐plex magneto‐fluorescent immunoassays, BioRad, USA). Results To characterize human CSF lipid signatures and their relationship to several apolipoproteins in pre‐symptomatic AD, we profiled and analyzed 21 classes of lipid species (for a total of 796 sub‐species) and 10 apolipoproteins in 120 cognitively unaffected subjects exhibiting various levels of total tau, p(181)tau and Aβ42. Figure 1 illustrates the signature profile (after FDR correction) following stratification by APOE‐ε4 genotype at the time of recruitment, when no cognitive deficit was detected. Please note the preferential associations between phosphatidylethanolamine acetate species and apoB levels in the CSF in non‐ε4 carrier. The apoD‐lipid signature profile was found to be very different in ε4 versus non‐ε4 carriers. Figure 2 illustrates the different associations between lipid species and the different apolipoproteins found in the CSF as a function of AD severity (stratified using the CSF T‐Tau/Aβ42 ratio). As ratio increases (top tertile) and pathology unfolds, the lipid signatures become markedly altered, with strong effects observed with apoB, apoD and apoJ interactions. Conclusion Our results suggest that early amyloid and tau pathologies modulate the release of specific lipid species in the CSF which alters their relationship with apolipoproteins in an APOE‐ε4‐dependent manner.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».