Exploring inflammation‐related protein expression and its relationship with TSPO PET in Alzheimer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Developing evidence highlight the importance of neuroinflammation in the progression of Alzheimer’s disease (AD) pathophysiology. It has been shown that inflammatory mechanisms affect both amyloid and tau deposition in the brain. However, given the complexity of the immune cascades and the unknown interactions between the peripheral and central nervous systems in the disease, it has been challenging to identify biomarkers that reflect a given inflammatory state in this context. Thus we aim here to further explore inflammation‐related proteins for potential biomarker utility in AD. Method Participants from the TRIAD cohort incorporating within the AD spectrum, and with available TSPO PET ([11C]PBR28) imaging data, had their cerebrospinal fluid (CSF) (n = 100) and plasma (n = 169) samples analyzed using Proximity Extension Assay (PEA) technology targeting 368 inflammation‐related proteins (Olink). LIMMA models evaluated the differential protein expression according to TSPO PET status (positivity attributed by 3 SD above the mean ROI‐SUVR of young participants), adjusting for age and brain amyloid load (PET). Associations were FDR corrected for multiple comparisons. Gene ontology (GO) was used for enrichment analysis on relevant results. Result Preliminary results identified several proteins that are in higher concentration in the CSF of TSPO positive in comparison with TSPO negative participants (Figure 1). The enrichment analysis (Figure 2) unveiled terms related with cytokine and chemokine signaling pathways as well as with the regulation of mitogen‐activated protein kinase (MAPK) cascade, which is an interesting finding given the frequently reported association between MAPK cascade and AD. Conclusion The initial assessment of the data revealed encouraging preliminary findings. However, more detailed analyses will be performed in both CSF and plasma to further investigate potential biomarkers and how they coverage between amyloid and tau deposition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».