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Enregistrement W4390244996 · doi:10.1016/j.ebiom.2023.104931

Clinical and genetic keys to cerebellar ataxia due to FGF14 GAA expansions

2023· article· en· W4390244996 sur OpenAlexafffundabout
Jean‐Loup Méreaux, Claire-Sophie Davoine, David Pellerin, Giulia Coarelli, Marie Coutelier, Claire Ewenczyk, Marie‐Lorraine Monin, Mathieu Anheim, Isabelle Le Ber, Stéphane Thobois, Florent Gobert, Léna Guillot‐Noël, Sylvie Forlani, Ludmila Jornéa, Anna Heinzmann, Aude Sangaré, Bertrand Gaymard, Lucie Guyant‐Maréchal, Perrine Charles, Cécilia Marelli, Jérôme Honnorat, Bertrand Degos, François Tison, Sophie Sangla, M. Simonetta‐Moreau, François Salachas, Maya Tchikviladzé, Giovanni Castelnovo, Fanny Mochel, Stephan Klebe, Anna Castrioto, Silvia Fenu, Aurélie Méneret, Frédéric Bourdain, Marion Wandzel, Virginie Roth, Céline Bonnet, Florence Riant, Giovanni Stévanin, Sandrine Noël, Anne‐Laure Fauret‐Amsellem, Melanie Bahlo, Paul J. Lockhart, Bernard Brais, Mathilde Renaud, Alexis Brice, Alexandra Dürr

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchEpilepsy SocietyFondation pour la Recherche MédicaleAssistance publique-Hôpitaux de ParisAgence Nationale de la RechercheIpsenAlnylam PharmaceuticalsPfizerAustralian GovernmentEVER Neuro PharmaEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchMerz PharmaceuticalsBundesministerium für Bildung und ForschungMedical Research CouncilBiogenEuropean Commission
Mots-clésAtaxiaCerebellar ataxiaCerebellumAlleleGeneticsSpinocerebellar ataxiaBiologyNeuroscienceMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background SCA27B caused by FGF14 intronic heterozygous GAA expansions with at least 250 repeats accounts for 10–60% of cases with unresolved cerebellar ataxia. We aimed to assess the size and frequency of FGF14 expanded alleles in individuals with cerebellar ataxia as compared with controls and to characterize genetic and clinical variability. Methods We sized this repeat in 1876 individuals from France sampled for research purposes in this cross-sectional study: 845 index cases with cerebellar ataxia and 324 affected relatives, 475 controls, as well as 119 cases with spastic paraplegia, and 113 with familial essential tremor. Findings A higher frequency of expanded allele carriers in index cases with ataxia was significant only above 300 GAA repeats (10.1%, n = 85) compared with controls (1.1%, n = 5) ( p < 0.0001) whereas GAA 250–299 alleles were detected in 1.7% of both groups. Eight of 14 index cases with GAA 250-299 repeats had other causal pathogenic variants (4/14) and/or discordance of co-segregation (5/14), arguing against GAA causality. We compared the clinical signs in 127 GAA ≥300 carriers to cases with non-expanded GAA ataxia resulting in defining a key phenotype triad: onset after 45 years, downbeat nystagmus, episodic ataxic features including diplopia; and a frequent absence of dysarthria. All maternally transmitted alleles above 100 GAA were unstable with a median expansion of +18 repeats per generation (r 2 = 0.44; p < 0.0001). In comparison, paternally transmitted alleles above 100 GAA mostly decreased in size (−15 GAA (r 2 = 0.63; p < 0.0001)), resulting in the transmission bias observed in SCA27B pedigrees. Interpretation SCA27B diagnosis must consider both the phenotype and GAA expansion size. In carriers of GAA 250-299 repeats, the absence of documented familial transmission and a presentation deviating from the key SCA27B phenotype, should prompt the search for an alternative cause. Affected fathers have a reduced risk of having affected children, which has potential implications for genetic counseling. Funding This work was supported by the Fondation pour la Recherche Médicale, grant number 13338 to JLM, the Association Connaître les Syndrome Cérébelleux – France (to GS) and by the European Union's Horizon 2020 research and innovation program under grant agreement No 779257 ("SOLVE-RD" to GS). DP holds a Fellowship award from the Canadian Institutes of Health Research (CIHR). SK received a grant (01GM1905C) from the Federal Ministry of Education and Research, Germany, through the TreatHSP network. This work was supported by the Australian Government National Health and Medical Research Council grants (GNT2001513 and MRFF2007677) to MB and PJL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,681
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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