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Enregistrement W4390450416 · doi:10.1101/2023.12.29.23300642

Five dominant dimensions of brain aging are identified via deep learning: associations with clinical, lifestyle, and genetic measures

2023· preprint· en· W4390450416 sur OpenAlexafffund
Zhijian Yang, Junhao Wen, Güray Erus, Sindhuja Tirumalai Govindarajan, Randa Melhem, Elizabeth Mamourian, Yuhan Cui, Dhivya Srinivasan, Ahmed Abdulkadir, Paraskevi Parmpi, Katharina Wittfeld, Hans J. Grabe, Robin Bülow, Stefan Frenzel, Duygu Tosun, Murat Bilgel, Yang An, Dahyun Yi, Daniel S. Marcus, Pamela LaMontagne, Tammie L.S. Benzinger, Susan R. Heckbert, Thomas R. Austin, Shari R. Waldstein, Michele K. Evans, Alan B. Zonderman, Lenore J. Launer, Aristeidis Sotiras, Mark A. Espeland, Colin L. Masters, Paul Maruff, Jürgen Fripp, Arthur W. Toga, Sid E. O’Bryant, M. Mallar Chakravarty, Sylvia Villeneuve, Sterling C. Johnson, John C. Morris, Marilyn S. Albert, Kristine Yaffe, Henry Völzke, Luigi Ferrucci, Nick Bryan, Russell T. Shinohara, Yong Fan, Mohamad Habes, Paris Alexandros Lalousis, Nikolaos Koutsouleris, David A. Wolk, Susan M. Resnick, Haochang Shou, Ilya M. Nasrallah, Christos Davatzikos

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierSiemens HealthineersEisaiBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungEuropean Bioinformatics InstitutePfizerNovartis Pharmaceuticals CorporationBiogenEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbBioClinicaAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-clésPsychologyBrain agingCognitive psychologyDevelopmental psychologyGerontologyEvolutionary biologyArtificial intelligenceClinical psychologyNeuroscienceCognitionMedicineBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brain aging is a complex process influenced by various lifestyle, environmental, and genetic factors, as well as by age-related and often co-existing pathologies. MRI and, more recently, AI methods have been instrumental in understanding the neuroanatomical changes that occur during aging in large and diverse populations. However, the multiplicity and mutual overlap of both pathologic processes and affected brain regions make it difficult to precisely characterize the underlying neurodegenerative profile of an individual from an MRI scan. Herein, we leverage a state-of-the art deep representation learning method, Surreal-GAN, and present both methodological advances and extensive experimental results that allow us to elucidate the heterogeneity of brain aging in a large and diverse cohort of 49,482 individuals from 11 studies. Five dominant patterns of neurodegeneration were identified and quantified for each individual by their respective (herein referred to as) R-indices. Significant associations between R-indices and distinct biomedical, lifestyle, and genetic factors provide insights into the etiology of observed variances. Furthermore, baseline R-indices showed predictive value for disease progression and mortality. These five R-indices contribute to MRI-based precision diagnostics, prognostication, and may inform stratification into clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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