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Enregistrement W4390576813 · doi:10.1084/jem.20231353

Higher COVID-19 pneumonia risk associated with anti-IFN-α than with anti-IFN-ω auto-Abs in children

2024· article· en· W4390576813 sur OpenAlexaff
Paul Bastard, Adrian Gervais, Maki Taniguchi, Liisa Saare, Karita Särekannu, Tom Le Voyer, Quentin Philippot, Jérémie Rosain, Lucy Bizien, Takaki Asano, Marina García-Prat, Alba Parra-Martínez, Mélanie Migaud, Miyuki Tsumura, Francesca Conti, Alexandre Bélot, Jacques G. Rivière, Tomohiro Morio, Junko Tanaka, Étienne Javouhey, Filomeen Haerynck, Sotiriјa Duvlis, Tayfun Özçelık, Sevgi Keleş, Yacine Tandjaoui-Lambiotte, Simon Escoda, M. Husain, Qiang Pan‐Hammarström, Lennart Hammarström, Gloria Ahlijah, A Haidar, Camille Soudée, Vincent Arseguel, Hassan Abolhassani, Sabina Sahanic, Ivan Tancevski, Yoko Nukui, Seiichi Hayakawa, George P. Chrousos, Athanasios Michos, Elizabeth‐Barbara Tatsi, Filippos Filippatos, Agustí Rodríguez‐Palmero, Jesús Troya, Imran Tipu, Isabelle Meyts, Lucie Roussel, Sisse Rye Ostrowski, Laire Schidlowski, Carolina Prando, Antônio Condino‐Neto, Nathalie Cheikh, Ahmed Aziz Bousfiha, Jalila El Bakkouri, Sergio Aguilera, Suzan A. AlKhater, Gülsüm Alkan, Riccardo Castagnoli, Cyril Cyrus, Şefika Elmas Bozdemir, Melike Emiroğlu, Belgi̇n Gülhan, Emine Hafize Erdeniz, Nevin Hatipoğlu, Gülsün Iclal Bayhan, Petr Jabandžiev, Saliha Kanık Yüksek, Adem Karbuz, Şadiye Kübra Tüter Öz, Gian Luigi Marseglia, Özge Metin Akcan, Ahmet Osman Kılıç, Aslınur Özkaya Parlakay, Maria Papadaki, Kateřina Slabá, Esra Şevketoğlu, Juan Valencia-Ramos, Aysun Yahşi, Antonio Antela López, Gema Barbeito Castiñeiras, Xabier Bello Paderne, Mirian Ben García, María Victoria Carral García, Miriam Cebey‐López, Amparo Coira, M. Pájaro, José Javier Costa Alcalde, María José Currás Tuala, Ana Isabel Dacosta Urbieta, Blanca Díaz Esteban, María Jesús Domínguez Santalla, Juan Fernández Villaverde, Cristóbal Galbán Rodríguez, José Luis García Allut, Luisa García Vicente, Elena Giráldez Vázquez, Alberto Gómez‐Carballa, José Gómez Rial, Francisco Javier González‐Barcala, Beatriz Guerra Liñares, Pilar Leboráns Iglesias, Beatriz Lence Massa, Marta Lendoiro Fuentes, Montserrat López Franco, Ana López Lago, Federico Martinón‐Torres, Antonio Salas, Daniel Navarro De la Cruz, Eloína Núñez Masid, Juan Bautista Ortolá Devesa, Jacobo Pardo‐Seco, María Pazo Núñez, Marisa Pérez del Molino Bernal, Hugo Pérez Freixo, Lidia Piñeiro Rodríguez, Sara Pischedda, Manuel Portela‐Romero, Antonio Pose Reino, Gloria María Prada Hervella, Teresa Queiro Verdes, Lorenzo Redondo-Collazo, Patricia Regueiro Casuso, Susana Rey García, Sara Rey Vázquez, Vanessa Riveiro Blanco, Irene Rivero‐Calle, Carmen Rivero Velasco, Nuria Núñez, Eva Saborido Paz, José Miguel Sadiki Orayyou, Carla Saito Villanueva, Sonia Serén Fernández, Pablo Souto Sanmartín, Rocío Trastoy, M. Castellano, Pablo Varela García, María Soledad Vilas Iglesias, Sandra Viz-Lasheras, Rocío Ferreiro‐Iglesias, Iria Bastón‐Rey, Cristina Suárez, Alessandro Aiuti, Saleh Al‐Muhsen, Fahd Al‐Mulla, Ali Amara, Mark S. Anderson, Andrés A. Arias, Lisa M. Arkin, Hagit Baris Feldman, Catherine M. Biggs, Dusan Bogunovic, Alexandre Bolze, Анастасія Бондаренко, Yenan T. Bryceson, Manish J. Butte, Giorgio Casari, John Christodoulou, Aurélie Cobat, Roger Colobrán, Stefan N. Constantinescu, Megan A. Cooper, Clifton L. Dalgard, Murkesh Desai, Beth A. Drolet, Xavier Duval, Jamila El Baghdadi, Philippine Eloy, Sara Elva Espinosa‐Padilla, Jacques Fellay, Carlos Flores, José Luis Franco, Antoine Froidure, Guy Gorochov, Peter K. Gregersen, Bodo Grimbacher, David Hagin, Rabih Halwani, James R. Heath, Elena W.Y. Hsieh, Eystein S. Husebye, Kohsuke Imai, Yuval Itan, Erich D. Jarvis, Emmanuelle Jouanguy, Elżbieta Kaja, Timokratis Karamitros, Cheng‐Lung Ku, YL Lau, Yun Ling, C. Lucas, Davood Mansouri, László Maródi, France Mentré, Joshua D. Milner, Kristina Mironska, Trine H. Mogensen, Lisa F. P. Ng, Luigi D. Notarangelo, Antonio Novelli, Giuseppe Novelli, Cliona O’Farrelly, Satoshi Okada, Keisuke Okamoto, Jean W. Pape, Rebeca Pérez de Diego, Jordi Pérez‐Tur, David S. Perlin, Graziano Pesole, Anna M. Planas, Anne Puel, Lluís Quintana‐Murci, Sathishkumar Ramaswamy, Laurent Rénia, Igor Resnick, Carlos Rodríguez‐Gallego, Vanessa Sancho‐Shimizu, Anna Šedivá, Mikko Seppänen, Mohammed Shahrooei, Anna Shcherbina, Ondřej Slabý, Andrew L. Snow, Pere Soler‐Palacín, Vassili Soumelis, András N. Spaan, Helen C. Su, Stuart G. Tangye, Ahmad Abou Tayoun, Şehime Gülsün Temel, Christian Thorball, Pierre Tiberghien, Sophie Trouillet‐Assant, Stuart E. Turvey, K. M. Furkan Uddin, Mohammed Uddin, Diederik van de Beek, Donald C. Vinh, Horst von Bernuth, Joost Wauters, Mayana Zatz, Paweł Zawadzki, Qian Zhang, Shen‐Ying Zhang, Pärt Peterson, Romain Lévy, Pierre Quartier, Bertrand Boisson, Vivien Béziat, A. Borghesi, Andrea Pession, Nico Marr, Alexios‐Fotios A. Mentis, Vallo Tillmann, Bénédicte Neven, Luis Ignacio González‐Granado

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesVlaamse regeringStavros Niarchos FoundationFonds Wetenschappelijk OnderzoekFondation pour la Recherche MédicaleFondation du SouffleInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleEuropean CommissionJapan Society for the Promotion of ScienceNovo Nordisk FondenInstitut des maladies génétiques ImagineMinistère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'InnovationKU LeuvenSt. Giles FoundationNational Institutes of HealthFisher Center for Alzheimer's Research FoundationMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational Center for Advancing Translational SciencesAgence Nationale de la RechercheNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésNeutralizing antibodyMedicinePneumoniaCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ImmunologyOdds ratioInterferonAntibodyAutoantibodySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyInternal medicineGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We found that 19 (10.4%) of 183 unvaccinated children hospitalized for COVID-19 pneumonia had autoantibodies (auto-Abs) neutralizing type I IFNs (IFN-α2 in 10 patients: IFN-α2 only in three, IFN-α2 plus IFN-ω in five, and IFN-α2, IFN-ω plus IFN-β in two; IFN-ω only in nine patients). Seven children (3.8%) had Abs neutralizing at least 10 ng/ml of one IFN, whereas the other 12 (6.6%) had Abs neutralizing only 100 pg/ml. The auto-Abs neutralized both unglycosylated and glycosylated IFNs. We also detected auto-Abs neutralizing 100 pg/ml IFN-α2 in 4 of 2,267 uninfected children (0.2%) and auto-Abs neutralizing IFN-ω in 45 children (2%). The odds ratios (ORs) for life-threatening COVID-19 pneumonia were, therefore, higher for auto-Abs neutralizing IFN-α2 only (OR [95% CI] = 67.6 [5.7-9,196.6]) than for auto-Abs neutralizing IFN-ω only (OR [95% CI] = 2.6 [1.2-5.3]). ORs were also higher for auto-Abs neutralizing high concentrations (OR [95% CI] = 12.9 [4.6-35.9]) than for those neutralizing low concentrations (OR [95% CI] = 5.5 [3.1-9.6]) of IFN-ω and/or IFN-α2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,371 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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