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Enregistrement W4390579404 · doi:10.1016/j.chembiol.2023.12.007

Discovery of dual-active ethionamide boosters inhibiting the Mycobacterium tuberculosis ESX-1 secretion system

2024· article· en· W4390579404 sur OpenAlexfundno aff
Raphael Gries, Jason Chhen, Edeltraud van Gumpel, Sebastian J. Theobald, Lindsay Sonnenkalb, Christian Utpatel, Fabian Metzen, Manuel Koch, Tobias Dallenga, Kamel Djaout, Alain R. Baulard, Michael Dal Molin, Jan Rybniker

Notice bibliographique

RevueCell chemical biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesHORIZON EUROPE Framework ProgrammeNational Institutes of HealthInnovative Medicines InitiativeBundesministerium für Bildung und ForschungUniversity of SaskatchewanDeutsche ForschungsgemeinschaftDeutsches Zentrum für InfektionsforschungAgence Nationale de la RechercheTexas Tech University
Mots-clésEthionamideMycobacterium tuberculosisVirulenceProdrugTuberculosisMicrobiologyAntimycobacterialSecretionDrug discoveryBiologyChemistryMedicineEthambutolPharmacologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drug-resistant Mycobacterium tuberculosis (Mtb) remains a major public health concern requiring complementary approaches to standard anti-tuberculous regimens. Anti-virulence molecules or compounds that enhance the activity of antimicrobial prodrugs are promising alternatives to conventional antibiotics. Exploiting host cell-based drug discovery, we identified an oxadiazole compound (S3) that blocks the ESX-1 secretion system, a major virulence factor of Mtb. S3-treated mycobacteria showed impaired intracellular growth and a reduced ability to lyse macrophages. RNA sequencing experiments of drug-exposed bacteria revealed strong upregulation of a distinct set of genes including ethA, encoding a monooxygenase activating the anti-tuberculous prodrug ethionamide. Accordingly, we found a strong ethionamide boosting effect in S3-treated Mtb. Extensive structure-activity relationship experiments revealed that anti-virulence and ethionamide-boosting activity can be uncoupled by chemical modification of the primary hit molecule. To conclude, this series of dual-active oxadiazole compounds targets Mtb via two distinct mechanisms of action.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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