OAS Gene Family Expression is Associated with Clinical Outcomes in Human Cancers
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The 2’, 5’-oligoadenylate synthetase (OAS) gene family plays an active role in antiviral immunity. Given their role in apoptosis and autoimmunity, aberrant expression of the OAS genes has been implicated in carcinogenesis. However, there has been minimal investigation of their potential role in tumorigenesis. Therefore, in this study, we used data from publicly available databases to examine the expression pattern of the OAS genes in different cancer tissues compared to normal tissues. The expression of the OAS genes was elevated in ten different cancer types. We observed significant association between the expression level of the OAS genes and overall survival (OS) in adrenocortical carcinoma (ACC), bladder urothelial carcinoma (BLCA), lower grade glioma (LGG), lung adenocarcinoma (LUAD), kidney renal papillary cell carcinoma (KIRP), pancreatic adenocarcinoma (PAAD), skin cutaneous melanoma (SKCM), kidney chromophobe (KICH), kidney renal cell carcinoma (KIRC), and thymoma (THYM). We also found interesting correlations between OAS gene expression and clinicopathological features, pathway enrichment, genetic alteration, copy number variations (CNVs), CD8 + T immune cell infiltration, and tumor purity in different cancers. Collectively, our findings indicate the potential utility of using the OAS family both as a diagnostic and prognostic biomarker and a therapeutic target in relevant cancers and contribute valuable insights into the intersection of cancer biology and treatment strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».