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Enregistrement W4390734723 · doi:10.1101/2024.01.05.574233

Wild bird mass mortalities in eastern Canada associated with the Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N1) virus, 2022

2024· preprint· en· W4390734723 sur OpenAlexaffabout
Stephanie Avery‐Gomm, Tatsiana Barychka, Matthew D. English, Robert A. Ronconi, Sabina I. Wilhelm, Jean‐François Rail, Tabatha L. Cormier, Matthieu Beaumont, Campbell Bowser, Tori V. Burt, Sydney M. Collins, Steven Duffy, Jolene A. Giacinti, Scott G. Gilliland, Jean‐François Giroux, Carina Gjerdrum, Magella Guillemette, Kathryn E. Hargan, Megan Jones, Andrew C. Kennedy, Liam Kusalik, Stéphane Lair, Andrew S. Lang, Raphaël A. Lavoie, Christine Lepage, Gretchen McPhail, William A. Montevecchi, Glen J. Parsons, Jennifer F. Provencher, Ishraq Rahman, Gregory J. Robertson, Yannick Seyer, Catherine Soos, Christopher R. E. Ward, Regina Wells, Jordan Wight

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversité de MontréalCégep de Rivière-du-LoupUniversité du Québec à MontréalMemorial University of NewfoundlandUniversity of Prince Edward IslandUniversité du Québec à RimouskiEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInfluenza A virus subtype H5N1Uria aalgeWaterfowlPopulationGeographyOutbreakWildlifeFisheryBiologyDemographySocioeconomicsEcologySeabirdVirusPredation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In 2022, a severe outbreak of clade 2.3.4.4b Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI) H5N1 virus resulted in unprecedented mortality among wild birds in eastern Canada. Tens of thousands of birds were reported sick or dead, prompting a comprehensive assessment of mortality spanning the breeding season between April 1 and September 30, 2022. Mortality reports were collated from federal, Indigenous, provincial, and municipal agencies, the Canadian Wildlife Health Cooperative, non-governmental organizations, universities, and citizen science platforms. A scenario analysis was conducted to refine mortality estimates, accounting for potential double counts from multiple sources under a range of spatial and temporal overlap. Correcting for double counting, an estimated 40,966 wild birds were reported sick or dead in eastern Canada during the spring and summer of 2022. Seabirds and sea ducks, long-lived species that are slow to recover from perturbations, accounted for 98.7% of reported mortalities. Mortalities were greatest among Northern Gannets (Morus bassanus ; 26,193), Common Murres ( Uria aalge ; 8,133), and American Common Eiders ( Somateria mollissima dresseri; 1,945), however, these figures underestimate total mortality as they exclude unreported deaths on land and at sea. In addition to presenting mortality estimates, we compare mortalities with known population sizes and trends and make an initial assessment of whether population-level impacts are possible for the Northern Gannet, a species that has suffered significant global mortality, and two harvested species, Common Murre and American Common Eider, to support management decisions. We hypothesize that population-level impacts in eastern Canada are possible for Northern Gannets and American Common Eiders but are unlikely for Common Murres. This study underscores the urgent need for further research to understand the broader ecological ramifications of the HPAI outbreak on wild bird populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,072

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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