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Enregistrement W4390824361 · doi:10.1002/pld3.563

Creating saponin‐free yellow pea seeds by <i>CRISPR/Cas9</i>‐enabled mutagenesis on β‐amyrin synthase

2024· article· en· W4390824361 sur OpenAlexafffund
Connor L. Hodgins, Eman M. Salama, Rahul Kumar, Yang Zhao, Susan A. Roth, Irene Z. Cheung, Jieyu Chen, Gene Arganosa, Thomas D. Warkentin, Pankaj Bhowmik, Byung‐Kook Ham, Dae‐Kyun Ro

Notice bibliographique

RevuePlant Direct · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensSaskatchewan Research Council (Canada)Global Institute for Water SecurityUniversity of SaskatchewanUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaRES’EAU-WaterNETAlberta Innovates
Mots-clésCRISPRMutagenesisCas9BiologySaponinATP synthaseGeneticsComputational biologyMutationGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Dry pea ( Pisum sativum ) seeds are valuable sources of plant protein, dietary fiber, and starch, but their uses in food products are restricted to some extent due to several off‐flavor compounds. Saponins are glycosylated triterpenoids and are a major source of bitter, astringent, and metallic off‐flavors in pea products. β‐amyrin synthase ( BAS ) is the entry point enzyme for saponin biosynthesis in pea and therefore is an ideal target for knock‐out using CRISPR/Cas9 genome editing to produce saponin deficient pea varieties. Here, in an elite yellow pea cultivar (CDC Inca), LC/MS analysis identified embryo tissue, not seed coat, as the main location of saponin storage in pea seeds. Differential expression analysis determined that PsBAS1 was preferentially expressed in embryo tissue relative to seed coat and was selected for CRISPR/Cas9 genome editing. The efficiency of CRISPR/Cas9 genome editing of PsBAS1 was systematically optimized in pea hairy roots. From these optimization procedures, the AtU6‐26 promoter was found to be superior to the CaMV35S promoter for gRNA expression, and the use of 37°C was determined to increase the efficiency of CRISPR/Cas9 genome editing. These promoter and culture conditions were then applied to stable transformations. As a result, a bi‐allelic mutation (deletion and inversion mutations) was generated in the PsBAS1 coding sequence in a T 1 plant, and the segregated psbas1 plants from the T 2 population showed a 99.8% reduction of saponins in their seeds. Interestingly, a small but statistically significant increase (~12%) in protein content with a slight decrease (~5%) in starch content was observed in the psbas1 mutants under phytotron growth conditions. This work demonstrated that flavor‐improved traits can be readily introduced in any pea cultivar of interest using CRISPR/Cas9. Further field trials and sensory tests for improved flavor are necessary to assess the practical implications of the saponin‐free pea seeds in food applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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