Molecular detection and characterization of the <i>Mycobacterium tuberculosis</i> complex subspecies responsible for bovine tuberculosis in Punjab, Pakistan
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Bovine tuberculosis (bTB), traditionally associated with Mycobacterium bovis , presents significant public health and economic challenges worldwide. This study investigated the causative agents of bTB in slaughtered cattle and buffalo in Lahore, Pakistan. Of the 3,581 animals screened, 34 were identified with gross TB-like lesions. The lesions were processed for culture, PCR, and Sanger sequencing to identify the causative agents of the disease. The results identified 10 Mycobacterium orygis and 8 Mycobacterium tuberculosis sensu stricto isolates. Whole-genome sequencing was performed on two M . orygis isolates, and the sequences were phylogenetically compared to 93 publicly available M. orygis sequences. The results also demonstrated that the JB21 and JB22 primers, which have been previously commonly applied to detect M. bovis in Pakistan, are unable to distinguish between M. tuberculosis complex subspecies. The identification of M. orygis and M. tuberculosis as causative agents of bTB in this slaughterhouse in Punjab may have important implications in identifying cases of zoonotic TB in humans and applying appropriate molecular tools to identify the prevalence of the disease. The data from this study align with recent findings suggesting M. orygis is the predominant cause of bTB in South Asia. IMPORTANCE The study findings hold significant relevance to the Journal of Clinical Microbiology, as they directly impact the field. The first-time identification of Mycobacterium orygis and Mycobacterium tuberculosis as the predominant causative agents of bovine tuberculosis in Lahore, Pakistan underscores the urgent need for enhanced diagnostic methods. The study emphasizes the importance of improved assays for the accurate detection and differentiation of Mycobacterium subspecies. Additionally, the research addresses zoonotic risk assessment and public health implications, advocating for a multidisciplinary approach that integrates clinical microbiology with veterinary and human health sectors. These insights contribute to clinical microbiology knowledge, shaping effective strategies for disease prevention, surveillance, and control. The study’s potential to advance the field makes it well suited for publication in the Microbiology Spectrum journal.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».