Establishing a Correlation of Clinical Characteristics with the Level of Tumor Mutation Burden in Urothelial Bladder Carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Bladder cancer is a complex disease and one of the most lethal types of cancer. Recently, some malignancies, including bladder carcinomas, have shown better results with immunotherapy using immune checkpoint inhibitors. Tumor mutational burden (TMB) is a potential biomarker for predicting tumor behavior and immunotherapy response as an outcome. Publicly available clinical data from the bladder cancer of TCGA project is used to analyze correlations of clinical variables with an increased tumor mutation burden (TMB) number compared with those with a lower number of mutations. The threshold for the high mutation burden in the analysis was set at 10 mutations (Mut) per Megabase (Mb). The Chi-Square test (χ2) was used to compare categorical data. The Chi-Square "Best first" method was used to find a correlation between clinical variables and TMB, then compared with the p-value of significance (p<0.05). A significant correlation was found between TMB and Race, Neoplasm Histologic Grade, and gender when applying the Best First/Chi-Square method to clinical variables and level of TMB. This enables further investigation and application of the prediction models of the level of TMB, responsiveness to immunotherapy, and prognosis based on the clinical features of the patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».