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Enregistrement W4391116455 · doi:10.1136/rmdopen-2023-003897

Human leucocyte antigens and Japanese patients with polymyalgia rheumatica: the protective effect of <i>DRB1*09:01</i>

2024· article· en· W4391116455 sur OpenAlexfundno aff
Shinichi Nogi, Shomi Oka, Takashi Higuchi, Hiroshi Furukawa, Kota Shimada, Takanori Azuma, Takao Sugiyama, Fuminori Hirano, Akira Okamoto, Misuzu Fujimori, Yoshiro Horai, Atsushi Ihata, Atsushi Hashimoto, Akiko Komiya, Toshihiro Matsui, Naoshi Fukui, Masao Katayama, Kiyoshi Migita, Shigeto Tohma

Notice bibliographique

RevueRMD Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPfizer JapanChugai PharmaceuticalMitsubishi Tanabe Pharma CorporationTeijin PharmaAstellas Foundation for Research on Metabolic DisordersAstellas PharmaMerck Sharp and DohmeOno PharmaceuticalEisaiDaiichi Sankyo EuropeAsahi Kasei Pharma CorporationPfizerJapan Research Foundation for Clinical PharmacologyAbbott JapanJapan Society for the Promotion of ScienceMitsui Sumitomo Insurance Welfare FoundationMinistry of Health, Labour and WelfareDaiwa Securities Health FoundationBristol-Myers SquibbEisai CanadaNakatomi FoundationTakeda Science FoundationJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésMedicinePolymyalgia rheumaticaInternal medicineGastroenterologyHaplotypeGenotypingHLA-DRB1GenotypeAntigenImmunologyHuman leukocyte antigenDiseaseGeneGiant cell arteritisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective The hallmarks of the chronic inflammatory disease polymyalgia rheumatica (PMR) include pain, and morning stiffness in areas of the neck, shoulder and pelvic girdle. The human leucocyte antigen ( HLA ) gene was reported to be an important risk factor for PMR, but it has not been analysed precisely, especially in populations other than Europeans. Methods Genotyping of DRB1 and DQB1 was performed in Japanese PMR patients (n=270) and controls (n=413). Associations between allele carrier and genotype frequencies were determined for PMR. Results DRB1*04:05 was associated with a predisposition to PMR (p=0.0006, Pc =0.0193, OR 1.85, 95% CI 1.31 to 2.62). DRB1*09:01 was associated with protection against PMR (p=1.46×10 −5 , Pc =0.0004, OR 0.40, 95% CI 0.26 to 0.61). A shared epitope (SE) associated with PMR (p=3.07×10 −6 , OR 2.11, 95% CI 1.54 to 2.88). DQB1*03:03 (p=0.0010, P c=0.0140, OR 0.52, 95% CI 0.35 to 0.77) was associated with protection against PMR and DQB1*04:01 (p=0.0009, P c=0.0140, OR 1.82, 95% CI 1.28 to 2.58) was associated with predisposition to PMR. A gene dosage effect was observed for DRB1*09:01 and DQB1*03:03 , but not for DRB1*04:05, SE or DQB1*04:01 . Haplotype and logistic regression analyses suggested a protective effect for DRB1*09:01 . Conclusion This study is the first to demonstrate predisposing associations of DRB1*04:05, SE, and DQB1*04:01 , and protective associations of DRB1*09:01 and DQB1*03:03 with PMR in Japanese patients. Our data indicate HLA has predisposing and protective effects on the pathogenesis of PMR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,255
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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