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Enregistrement W4391146828 · doi:10.1016/j.gimo.2024.101814

Genetics Adviser: The development and usability testing of a new patient digital health application to support clinical genomic testing

2024· article· en· W4391146828 sur OpenAlexafffund
Marc Clausen, Suvetha Krishnapillai, Daena Hirjikaka, Rita Kodida, Salma Shickh, Emma Reble, Chloe Mighton, Jordan Sam, Ella Adi-Wauran, Nancy N. Baxter, Geoff Feldman, Emily Glogowski, Jordan Lerner‐Ellis, Adena Scheer, Serena Shastri-Estrada, Cheryl Shuman, Susan Randall Armel, Melyssa Aronson, Tracy Graham, Seema Panchal, Kevin E. Thorpe, June Carroll, Andrea Eisen, Christine Elser, Raymond H. Kim, Hanna Faghfoury, Kasmintan A. Schrader, Emily Seto, Yvonne Bombard

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensInstitute of Cancer ResearchOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenPublic Health OntarioPrincess Margaret Cancer CentreSinai Health SystemSunnybrook HospitalUniversity Health NetworkUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésUsabilityGenetic testingMedicineComputer scienceGeneticsHuman–computer interactionBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: Increasing demand for genomic testing coupled with genetics workforce shortages has placed unsustainable pressure on standard models of care. Digital tools can offer improved access, efficiency, and cost savings. We created a patient-facing digital health application to support genomic testing. Methods: We developed the digital application through user-centered design, guided by an advisory board. We tested its usability and acceptability with patients, practitioners, and members of the general public using mixed methods; data were analyzed using qualitative description and descriptive statistics. Results: The "Genetics Adviser" delivers pre-test education, counseling, and post-test return of results adaptable to any population, test platform, and setting. Usability testing with 25 patients, the general public, and genetics practitioners (15/25 female; mean age range 40-49 years) demonstrated enthusiasm about the application; users found it easy to navigate and comprehend. Acceptance testing with 19 patients and the public (13/19 female; mean age range 40-49 years) indicated high acceptability of the application and moderate knowledge of genomic sequencing after use. Conclusion: The Genetics Adviser is a comprehensive, interactive, patient-centered application found to have high acceptability and usability for pre- and post-test genomic testing, counseling, and return of results adaptable for multiple testing platforms, populations, and settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,058

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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