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Enregistrement W4391248914 · doi:10.1109/nss/mic44845.2022.10399086

Deep Adaptive Transfer Learning for Site-Specific PET Attenuation and Scatter Correction from Multi-National/Institutional Datasets

2022· article· en· W4391248914 sur OpenAlexaffabout
Isaac Shiri, Yazdan Salimi, Mehdi Maghsudi, Ghasem Hajianfar, Esmail Jafari, Rezvan Samimi, Maziar Khateri, Peyman Sheikhzadeh, Parham Geramifar, Habibollah Dadgar, Ahmad Bitrafan Rajabi, Majid Assadi, François Bénard, Carlos Uribe, Arman Rahmim, Habib Zaidi

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDeep learningArtificial intelligenceTransfer of learningComputer scienceGeneralizability theoryMachine learningPattern recognition (psychology)Nuclear medicineMathematicsMedicineStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Attenuation and scatter correction (ASC) must be performed for quantitative PET imaging. ASC is a challenging task in PET-only and PET/MRI systems. Different single-center or scanner-specific studies have been performed by using deep learning (DL) algorithms. However, the generalizability of these models is limited. In addition, providing large datasets for data-hungry DL models is a bottleneck. However, a universal model may not perform very well for each center because of high variability across different centers in scanners and image acquisition and reconstruction protocols. Therefore, we aimed to apply deep transfer learning for site-specific PET ASC utilizing a multi-center dataset. Altogether, 43068Ga-PSMA/DOTA PET/CT images from three countries (Switzerland, Iran, and Canada), including eight different centers, were enrolled in this study. In all centers, PET images were corrected by using CT images for ASC. In addition, we implemented a deep supervised U-Net network architecture, U2Net, as the core DL model. Different scenarios were investigated in this study, including (i) training and testing models for each center separately: center-based (CeBa); (ii) training and testing models using the entirety of the dataset: centralized (CeZe); i.e., entire data pooled together; and (iii) transfer learning (TrLe) where training was performed using pooled data to one server using entire dataset and then TrLe were performed for each center separately to build site-specific models for each center. In terms of absolute relative error (ARE%), CeBa, CeZe, and TrLe achieved 36 ± 13 (CI95%: 33 to 39), 31 ± 34 (CI95%: 24 to 38).Furthermore, using TrLe outperformed the centralized and center-based models in terms of accurate ASC image generation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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