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Enregistrement W4391250270 · doi:10.21203/rs.3.rs-3897886/v1

Apolipoprotein-A1 transports and regulates MMP2 in the blood

2024· preprint· en· W4391250270 sur OpenAlexafffund
Hassan Sarker, Rashmi Panigrahi, Ana Lopez-Campistrous, Todd McMuellen, Ken Reyes, Elena Anderson, Vidhya Krishnan, Samuel Hernandez‐Anzaldo, J. N. Mark Glover, Eugenio Hardy, Carlos Fernández-Patrón

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésApolipoprotein BBusinessInternal medicineMedicineCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Synthesized in the liver and intestines, apolipoprotein A1 (ApoA1) is the major protein component of high-density lipoprotein (HDL) particles and transports cholesterol from peripheral organs to the liver. This interorgan communication strategy may protect against atherogenesis by sequestering cholesterol from atherosclerotic lesions. Here, we found that ApoA1 has high affinity for the catalytic groove and fibronectin-like repeats of matrix metalloproteinase 2 (MMP2), the most abundant MMP in human blood. In healthy humans and ApoA1-expressing mice, we found that MMP2 is associated with ApoA1 in HDL. We confirmed the ApoA1/MMP2 interactions using five orthogonal interaction proteomics assays. Strikingly, we found that Apoa1 can allosterically increase the proteolytic activity of MMP2—an effect not observed in ApoA1-deficient plasma from ApoA1 KO mice. This finding was not predictable, as MMP2 was not previously known to be an allosteric enzyme. Using a high-confidence artificial intelligence (AlfaFold)-based structural model of the ApoA1/MMP2 complex, we explain how ApoA1 binds and allosterically regulates MMP2. We suggest that ApoA1 sequesters MMP2 in the blood circulation and redistributes it to ApoA1 target organs, such as the liver. This interorgan communication mechanism is independent of canonical reverse cholesterol transport by ApoA1/HDL and may prevent MMP2-mediated rupture of atherosclerotic plaques. Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,157

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0470,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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