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Enregistrement W4391341422 · doi:10.22541/au.170664051.11929717/v1

Identification of predictive biomarkers of response to treatment in patients with antibody mediated rejection: a case –control proteomics study

2024· preprint· en· W4391341422 sur OpenAlexaff
Mohsen Nafar, Shiva Samavat, Shiva Kalantari, Leonard J. Foster, Kyung‐Mee Moon, Nooshin Dalili, somaye Heidari

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiomarkerProteomicsMedicineUrineAntibodyInternal medicineQuantitative proteomicsBiomarker discoveryOncologyImmunologyBioinformaticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Timely detection and appropriate treatment of Acute antibody mediated rejection (AMR) would affect long-term survival of allograft. This study was designed to discover non-invasive biomarkers in prediction of response to therapy in AMR patients. Material and methods: in this case- control study, urine samples of 21 biopsy proven AMR patients were were subjected to proteomics with label free quantification. Patients were allocated into two groups of responders and non- responders to treatment. Urine proteins were identified and their expressions were compared in two groups in order to discover potential candidate biomarkers. Results: From 1020 identified proteins, 257 proteins were differentially expressed between groups among them 153 and 104 proteins increased and decreased in non- responder patients respectively. Complement pathway was more active in non-responders than responders and, extracellular matrix proteins were mainly reduced in non-responders. IGFBP-6 were determined as the most sensitive and specific biomarker in prediction of non-responder patients. Conclusion: According to the role of IGFBP-6 in apoptosis induction and tubular damage, up-regulation of this protein could be a good predictor of response to treatment in AMR patients and treatment approach could be determined based on IGFBP_6 changes. Further studies are needed to confirm these findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,712

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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