MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4391450121 · doi:10.1101/2024.01.29.577477

Behavioural responses to acute warming precede critical shifts in the cellular and physiological thermal stress responses in fish

2024· preprint· en· W4391450121 sur OpenAlexafffund
Travis C. Durhack, Matt J. Thorstensen, Theresa E. Mackey, Mélanie Aminot, Michael Lawrence, Céline Audet, Eva C. Enders, Ken M. Jeffries

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensUniversity of WinnipegUniversité de MonctonInstitut National de la Recherche ScientifiqueUniversity of ManitobaUniversité du Québec à RimouskiFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome Canada
Mots-clésTranscriptomeSalvelinusCritical thermal maximumBiologyAcclimatizationFight-or-flight responseHeat shockHeat shock proteinCellular stress responseTroutFish <Actinopterygii>EcologyOxidative stressRespirometryZoologyGene expressionGeneGeneticsEndocrinologyBiochemistryFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract From a conservation perspective, it is important to identify when sub-lethal temperatures begin to adversely impact an organism. However, it is unclear whether, during acute exposures, these cellular thresholds occur at similar temperatures to other physiological or behavioural changes. To test this, we estimated temperature preference (15.1 ± 1.1 °C) using a shuttle box, thermal optima for aerobic scope (10–15 °C) using respirometry, agitation temperature (22.0 ± 1.4 °C) as the point where a fish exhibits a behavioural avoidance response and the CT max (28.2 ± 0.4 °C) as the upper thermal limit for 1 yr old Brook Trout ( Salvelinus fontinalis ) acclimated to 10 °C. We then acutely exposed a different subset of fish to these temperatures and sampled tissues when they reached the target temperature or after 60 min of recovery at 10 °C. We used qPCR to estimate mRNA transcript levels of genes associated with heat shock proteins, oxidative stress, apoptosis, and inducible transcription factors. A major shift in the transcriptome response occurred near the agitation temperature, which may identify a link between the cellular stress response and the behavioural avoidance response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetPhysiological and biochemical adaptations→Travaux en français237 207→