Examining rainbow trout vig-3 expression patterns in vitro following treatment with type I IFN, poly IC or viral infection
Notice bibliographique
Résumé
Interferon-stimulated genes (ISGs) are key mediators of antiviral immunity. Investigating ISGs can help create novel therapeutics to increase survival rates of farmed fish and aid in protection against pathogens. The current study investigated the induction of one such ISG, viral hemorrhagic septicemia (VHSV) – induced gene 3 (vig-3), also known as ISG15 in mammals and other fish species. Vig-3 is one many rainbow trout ISGs whose expression patterns, induction and role remain relatively unknown. In this study, vig-3 transcript expression was identified in a panel of tissues from healthy rainbow trout. Vig-3 transcripts were upregulated in response to recombinant type I interferon (IFN-I) treatment in rainbow trout gonadal cells (RTG-2). Vig-3 transcript and protein levels were upregulated overtime following treatment with a double-stranded (ds)RNA molecule, polyinosinic: polycytidylic acid (poly IC), and infection with two viruses, infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) and viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) in two rainbow trout cell lines, RTG-2 and RTgill-W1. Vig-3 transcript expression kinetics positively corelated with viral replication kinetics. Western blot analysis demonstrated evidence of protein ISGylation, a unique feature of vig-3. Vig-3’s cellular localization was assessed using immunocytochemistry following viral infection. Vig-3 expression was cytoplasmic and increased in quantity over time, upon treatment with poly IC, or infection with IPNV or VHSV. These findings improve our understanding of the rainbow trout innate immune system and could aid in the production of fish antiviral therapeutics in the future.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».