The gut virome is associated with stress-induced changes in behaviour and immune responses in mice
Notice bibliographique
Résumé
The microbiota-gut-brain axis has been shown to play an important role in the stress response, but previous work has focused primarily on the role of the bacteriome. The gut virome constitutes a major portion of the microbiome, with bacteriophages having the potential to remodel bacteriome structure and activity. Here we use a mouse model of chronic social stress, and employ 16S rRNA and whole metagenomic sequencing on faecal pellets to determine how the virome is modulated by and contributes to the effects of stress. We found that chronic stress led to behavioural, immune and bacteriome alterations in mice that were associated with changes in the bacteriophage class Caudoviricetes and unassigned viral taxa. To determine whether these changes were causally related to stress-associated behavioural or physiological outcomes, we conducted a faecal virome transplant from mice before stress and autochthonously transferred it to mice undergoing chronic social stress. The transfer of the faecal virome protected against stress-associated behaviour sequelae and restored stress-induced changes in select circulating immune cell populations, cytokine release, bacteriome alterations and gene expression in the amygdala. These data provide evidence that the virome plays a role in the modulation of the microbiota-gut-brain axis during stress, indicating that these viral populations should be considered when designing future microbiome-directed therapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».