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Enregistrement W4391612020 · doi:10.1038/s41380-023-02392-6

White matter diffusion estimates in obsessive-compulsive disorder across 1653 individuals: machine learning findings from the ENIGMA OCD Working Group

2024· article· en· W4391612020 sur OpenAlexafffund
Bo‐Gyeom Kim, Gakyung Kim, Yoshinari Abe, Pino Alonso, Stephanie H. Ameis, Alan Anticevic, Paul Arnold, Srinivas Balachander, Nerisa Banaj, Núria Bargalló, Marcelo C. Batistuzzo, Francesco Benedetti, Sara Bertolín, Jan C. Beucke, Irene Bollettini, Silvia Brem, Brian P. Brennan, Jan K. Buitelaar, Rosa Calvo, Miguel Castelo‐Branco, Yuqi Cheng, Ritu Bhusal Chhatkuli, Valentina Ciullo, Ana Coelho, Beatriz Couto, Sara Dallaspezia, Benjamin A. Ely, Sónia Ferreira, Martine Fontaine, Jean‐Paul Fouché, Rachael Grazioplene, Patricia Gruner, Kristen Hagen, Bjarne Hansen, Gregory L. Hanna, Yoshiyuki Hirano, Marcelo Q. Höxter, Morgan Hough, Hao Hu, Chaim Huyser, Toshikazu Ikuta, Neda Jahanshad, Anthony James, Fern Jaspers‐Fayer, Selina Kasprzak, Norbert Kathmann, Christian Kaufmann, Minah Kim, Kathrin Koch, Gerd Kvale, Jun Soo Kwon, Luisa Lázaro, Junhee Lee, Christine Löchner, Jin Lü, Daniela Rodriguez Manrique, Ignacio Martínez‐Zalacaín, Yoshitada Masuda, Koji Matsumoto, Maria Paula Maziero, José M. Menchón, Luciano Minuzzi, Pedro Silva Moreira, Pedro Morgado, Janardhanan C. Narayanaswamy, Jin Narumoto, Ana E. Ortiz, Junko Ota, José C. Pariente, Chris Perriello, Maria Picó‐Pérez, Christopher Pittenger, Sara Poletti, Eva Real, Y. C. Janardhan Reddy, Daan van Rooij, Yuki Sakai, João Ricardo Sato, Cinto Segalàs, Roseli Gedanke Shavitt, Zonglin Shen, Eiji Shimizu, Venkataram Shivakumar, Carles Soriano‐Mas, Nuno Sousa, Mafalda Machado Sousa, Gianfranco Spalletta, Emily Stern, S. Evelyn Stewart, Philip R. Szeszko, Rajat M. Thomas, Sophia I. Thomopoulos, Daniela Vecchio, Ganesan Venkatasubramanian, Chris Vriend, Susanne Walitza, Zhen Wang, Anri Watanabe, Lidewij H. Wolters, Jian Xu, Kei Yamada, Je‐Yeon Yun, Mojtaba Zarei, Qing Zhao, Xi Zhu, Honami Arai, Ana Isabel Araújo, Kentaro Araki, Justin T. Baker, John R. Best, Premika S.W. Boedhoe, Sven Bölte, Vilde Brecke, Carolina Cappi, João Castelhano, Wei Chen, Sutoh Chihiro, Kang Ik Kevin Cho, Sunah Choi, Daniel L. Costa, Nan Dai, Shareefa Dalvie, Damiaan Denys, Juliana Belo Diniz, Isabel Catarina Duarte, Calesella Federico, Jamie D. Feusner, Kate D. Fitzgerald, Egill A. Friðgeirsson, Edna Grünblatt, Sayo Hamatani, Mengxin He, Odile A. van den Heuvel, Keisuke Ikari, Jonathan Ipser, Hongyan Jiang, Linling Jiang, Niels T. de Joode, Taekwan Kim, Hitomi Kitagawa, Masaru Kuno, Yoo Bin Kwak, Wieke van Leeuwen, Chiang‐Shan R. Li, Na Li, Yanni Liu, Fang Liu, Antônio Carlos Lopes, Yuri Milaneschi, Hein J. F. van Marle, Sergi Mas, David Mataix‐Cols, Maria Alice de Mathis, Maria Paula Mazieiro, Sarah E. Medland, Renata Amanajás De Melo, Eurı́pedes Constantino Miguel, Ástrid Morer, Alessandro S. De Nadai, Tomohiro Nakao, Masato Nihei, Luke Norman, Erika L. Nurmi, Joseph O’Neil, Sanghoon Oh, Sho Okawa, John Piacentini, Natàlia Rodríguez, Renata Silva, Michael C. Stevens, Anouk van der Straten, Jumpei Takahashi, Tais Tanamatis, Jinsong Tang, Anders Lillevik Thorsen, David F. Tolin, Anne Uhlmann, Benedetta Vai, Ysbrand D. van der Werf, Dick J. Veltman, Nora C. Vetter, Jicai Wang, Cees J. Weeland, Guido van Wingen, Stella J. de Wit, Nicole Wolff, Xiufeng Xu, Tokiko Yoshida, Fengrui Zhang, Paul M. Thompson, Willem B. Bruin, Fabrizio Piras, Dan J. Stein, Blair Simpson, Rachel Marsh, Jiook Cha

Notice bibliographique

RevueMolecular Psychiatry · 2024
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityBC Mental Health & Substance Use ServicesMcMaster UniversityHotchkiss Brain InstituteUniversity of CalgarySt. Joseph’s Healthcare HamiltonUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenBC Children's HospitalUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Mental HealthNational Research FoundationInstituto de Salud Carlos IIIConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Science and ICT, South KoreaInstitute for Information and Communications Technology PromotionThe Wellcome Trust DBT India AllianceNational Center for Advancing Translational SciencesNational Research Foundation of KoreaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyBC Children's HospitalInternational OCD FoundationMichael Smith Health Research BCBC Children’s Hospital FoundationDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaSamsungDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaWellcome TrustSeoul National UniversityEuropean CommissionJapan Agency for Medical Research and DevelopmentU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésWhite matterObsessive compulsivePsychologyDiffusion MRIWhite (mutation)PsychiatryMedicineMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

White matter pathways, typically studied with diffusion tensor imaging (DTI), have been implicated in the neurobiology of obsessive-compulsive disorder (OCD). However, due to limited sample sizes and the predominance of single-site studies, the generalizability of OCD classification based on diffusion white matter estimates remains unclear. Here, we tested classification accuracy using the largest OCD DTI dataset to date, involving 1336 adult participants (690 OCD patients and 646 healthy controls) and 317 pediatric participants (175 OCD patients and 142 healthy controls) from 18 international sites within the ENIGMA OCD Working Group. We used an automatic machine learning pipeline (with feature engineering and selection, and model optimization) and examined the cross-site generalizability of the OCD classification models using leave-one-site-out cross-validation. Our models showed low-to-moderate accuracy in classifying (1) "OCD vs. healthy controls" (Adults, receiver operator characteristic-area under the curve = 57.19 ± 3.47 in the replication set; Children, 59.8 ± 7.39), (2) "unmedicated OCD vs. healthy controls" (Adults, 62.67 ± 3.84; Children, 48.51 ± 10.14), and (3) "medicated OCD vs. unmedicated OCD" (Adults, 76.72 ± 3.97; Children, 72.45 ± 8.87). There was significant site variability in model performance (cross-validated ROC AUC ranges 51.6-79.1 in adults; 35.9-63.2 in children). Machine learning interpretation showed that diffusivity measures of the corpus callosum, internal capsule, and posterior thalamic radiation contributed to the classification of OCD from HC. The classification performance appeared greater than the model trained on grey matter morphometry in the prior ENIGMA OCD study (our study includes subsamples from the morphometry study). Taken together, this study points to the meaningful multivariate patterns of white matter features relevant to the neurobiology of OCD, but with low-to-moderate classification accuracy. The OCD classification performance may be constrained by site variability and medication effects on the white matter integrity, indicating room for improvement for future research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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