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Enregistrement W4391655713 · doi:10.1183/13993003.02301-2023

Cluster analysis to identify long COVID phenotypes using<sup>129</sup>Xe magnetic resonance imaging: a multicentre evaluation

2024· article· en· W4391655713 sur OpenAlexafffund
Rachel L. Eddy, David Mummy, Shuo Zhang, Haoran Dai, Aryil Bechtel, Alexandra M. Schmidt, Bradie Frizzell, Firoozeh V. Gerayeli, Jonathon Leipsic, Janice M. Leung, Bastiaan Driehuys, Loretta G. Que, Mario Castro, Don D. Sin, Peter Niedbalski

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAtomic and Subatomic Physics Research
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchDuke HealthSt. Paul's Foundation
Mots-clésMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Magnetic resonance imagingCluster (spacecraft)2019-20 coronavirus outbreakSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)PhenotypeNuclear magnetic resonanceNuclear medicineVirologyRadiologyPathologyPhysicsGeneticsOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Long COVID impacts ∼10% of people diagnosed with coronavirus disease 2019 (COVID-19), yet the pathophysiology driving ongoing symptoms is poorly understood. We hypothesised that 129 Xe magnetic resonance imaging (MRI) could identify unique pulmonary phenotypic subgroups of long COVID. Therefore, we evaluated ventilation and gas exchange measurements with cluster analysis to generate imaging-based phenotypes. Methods COVID-negative controls and participants who previously tested positive for COVID-19 underwent 129 Xe MRI ∼14 months post-acute infection across three centres. Long COVID was defined as persistent dyspnoea, chest tightness, cough, fatigue, nausea and/or loss of taste/smell at MRI; participants reporting no symptoms were considered fully recovered. 129 Xe MRI ventilation defect percent (VDP) and membrane-to-gas (Mem/Gas), red blood cell-to-membrane (RBC/Mem) and red blood cell-to-gas (RBC/Gas) ratios were used in k-means clustering for long COVID, and measurements were compared using ANOVA with post-hoc Bonferroni correction. Results We evaluated 135 participants across three centres: 28 COVID-negative (mean± sd age 40±16 years), 34 fully recovered (42±14 years) and 73 long COVID (49±13 years). RBC/Mem (p=0.03) and forced expiratory volume in 1 s (FEV 1 ) (p=0.04) were different between long COVID and COVID-negative; FEV 1 and all other pulmonary function tests (PFTs) were within normal ranges. Four unique long COVID clusters were identified compared with recovered and COVID-negative. Cluster 1 was the youngest with normal MRI and mild gas trapping; Cluster 2 was the oldest, characterised by reduced RBC/Mem but normal PFTs; Cluster 3 had mildly increased Mem/Gas with normal PFTs; and Cluster 4 had markedly increased Mem/Gas with concomitant reduction in RBC/Mem and restrictive PFT pattern. Conclusions We identified four 129 Xe MRI long COVID phenotypes with distinct characteristics. 129 Xe MRI can dissect pathophysiological heterogeneity of long COVID to enable personalised patient care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,852
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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