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Enregistrement W4391810436 · doi:10.3390/siuj5010006

“Pass the Genetic Scalpel”: A Comprehensive Review of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) in Urological Cancers

2024· review· en· W4391810436 sur OpenAlexvenueno aff
Arthur Yim, Matthew Alberto, Marco J. Herold, Dixon Woon, Joseph Ischia, Damien Bolton

Notice bibliographique

RevueSociété Internationale d’Urologie Journal · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCRISPRPTENProstate cancerMedicineBladder cancerCancer researchCancerOncologyBioinformaticsInternal medicineBiologyPI3K/AKT/mTOR pathwayGeneApoptosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Urological cancers account for a significant portion of cancer diagnoses and mortality rates worldwide. The traditional treatment options of surgery and chemoradiation can have significant morbidity and become ineffective in refractory disease. The discovery of the CRISPR system has opened up new avenues for cancer research by targeting specific genes or mutations that play a role in cancer development and progression. In this review, we summarise the current state of research on CRISPR in urology and discuss its potential for improving the diagnosis and treatment of urological cancers. Methods: A comprehensive literature search was conducted on databases including PubMed, Embase, and Cochrane Library. The keywords included CRISPR and urology OR prostate OR renal OR bladder OR testicular cancer. Results: CRISPR has been used extensively in a preclinical setting to identify and target genes in prostate cancer, including AR, NANOG, ERβ, TP53, PTEN, and PD-1. Targeting PRRX2 and PTEN has also been shown to overcome enzalutamide and docetaxel resistance in vitro. In bladder cancer, CBP, p300, hTERT, lncRNA SNGH3, SMAD7e, and FOXA1 have been targeted, with HNRNPU knockout demonstrating tumour inhibition, increased apoptosis and enhanced cisplatin sensitivity both in vitro and in vivo. Renal cancer has seen CRISPR target VHL, TWIST1, PTEN, and CD70, with the first in-human clinical trial of Anti-CD70 CAR T cell therapy showing an excellent safety profile and durable oncological results. Lastly, testicular cancer modelling has utilised CRISPR to knockout FLNA, ASH2L, HMGB4, CD24, and VIRMA, with NAE1 found to be over-expressed in cisplatin-resistant germ cell colonies. Conclusions: CRISPR is a cutting-edge technology that has been used extensively in the pre-clinical setting to identify new genetic targets, enhance drug sensitivity, and inhibit cancer progression in animal models. Although CAR T cell therapy has shown promising results in RCC, CRISPR-based therapeutics are far from mainstream, with further studies needed across all urological malignancies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0070,006
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,364 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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