MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4391873710 · doi:10.1093/jcag/gwad061.061

A61 ELUCIDATING INTESTINAL EPITHELIAL INFLAMMASOME MECHANISMS THAT REPAIR THE MUCOSAL BARRIER DURING ENTERIC INFECTION

2024· article· en· W4391873710 sur OpenAlexaff
Adrienne Ranger, Sagar M. Goyal, Stephen E. Girardin

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEosinophilic Esophagitis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInflammasomeEnteric feverMicrobiologyEnteric bacteriaIntestinal mucosaEnteric virusBiologyImmunologyMedicineInflammationInternal medicineEscherichia coliGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background To protect the gastrointestinal tract from infection, intestinal epithelial cells (IECs) lining the mucosa possess cytosolic complexes called inflammasomes which detect pathogenic insult and rapidly initiate inflammation to stop infectious spread. Active inflammasomes mediate crucial effector functions such as epithelial cell extrusion, pyroptotic cell death, and the release of interleukin (IL)-18 and prostaglandin E2 (PGE2). Recent literature has shown that IL-18 and PGE2 mediate intestinal repair following epithelial damage from DSS-induced colitis. Exogenous administration of IL-18 in inflammasome deficient mice improves survival and reduces pathology. PGE2 activates intestinal cellular reprogramming to drive intestinal wound healing. Whether inflammasome derived IL-18 and PGE2 mediate epithelial repair during enteric infection is unclear. Aims Using murine small intestinal organoids (mSIOs), we will investigate how IL-18 and PGE2 production by intestinal inflammasomes directly impacts IECs at both transcriptional and physiological levels. We hypothesize that inflammasome derived IL-18 and PGE2 will act on the intestinal epithelium resulting in transcriptional reprogramming that promotes tissue regeneration and barrier reinforcement. Methods WT and Nlrc4-/- mSIOs were stimulated with flagellin or FlaTox to activate the NAIP-NLRC4 inflammasome. The transcriptomic landscape was assessed with bulk-RNA sequencing and inflammasome activation was assessed by Western blot. IL-18 and PGE2 dependent gene targets were identified using Il-18-/- and indomethacin treated mSIOs by RT-qPCR. Results Bulk-RNA sequencing revealed an inflammasome activation dependent transcriptional signature in murine IECs upon NAIP-NLRC4 inflammasome activation. GO term analysis showed these genes to be involved in actin cytoskeleton rearrangement, epidermal growth factor signaling, and regulation of cell-cell adhesion. The expression of PGE2 gene targets were significantly reduced by indomethacin treatment while IL-18 gene targets remained unaffected in Il-18-/- IECs. FlaTox induced the same transcriptional changes but substantially amplified their expression. FlaTox but not flagellin led to a significant drop in Lgr5 (stem cells) and Lyz1 (Paneth cell) expression and an increase in Ly6a, a marker of fetal-like stem cells. Conclusions This data demonstrates that inflammasome signaling causes transcriptional reprogramming of IECs that activates pathways involved in maintaining epithelial barrier integrity. While IL-18 had no effects on gene expression at 4 hours, PGE2 paracrine signaling contributed to the expression of wound healing genes. Stronger inflammasome mediated damage with FlaTox amplified the repair response at the transcript level and we observed transient reprogramming of IECs into a fetal-like state suggesting active tissue regeneration. Funding Agencies CCC, CIHREPIC: Emerging & Pandemic Infections Consortium

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Canadian Association of GastroenterologyMême sujetEosinophilic EsophagitisTravaux en français237 207