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Enregistrement W4391915303 · doi:10.1002/chem.202303699

3‐Oxidopyridinium Ions Are Versatile Bioorthogonal Dipoles for Use in Cycloadditions with Cyclooctynes

2024· article· en· W4391915303 sur OpenAlexaff
Mariam Serhan, Jason D. Josephson, Shadi Sedghi Masoud, Masaya Nakajima, John Paul Pezacki

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueClick Chemistry and Applications
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBioorthogonal chemistryIonDipoleChemistryCombinatorial chemistryNanotechnologyComputational chemistryMaterials scienceOrganic chemistryClick chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract 3‐oxidopyridinium ions are water stable and soluble heteroaromatic betaines that behave as latent dipoles and undergo a wide variety of cycloadditions. Research into the cycloaddition reactions of 3‐oxidopyridiniums was spearheaded by Alan R. Katritzky and collaborators from the early 1970s until the late 1980s, but they have yet to be used for bioorthogonal applications. Herein we report that 3‐oxidopyridiniums can readily react with 4‐dibenzocyclooctynol (DIBO), a common bioorthogonal handle, in a [3+2] cycloaddition. The mechanism was investigated by altering the electronics of the reaction by changing the substituent on the 5 position of the pyridinium. Electron‐donating 5‐substituents have been shown to significantly increase the rate of the reaction, with bimolecular rate constants ranging from 3.3×10 −4 s −1 with 5‐trifluoromethyl‐ N ‐methyl‐3‐oxidopyridinium to 1.07 M −1 s −1 with 5‐amino‐ N ‐methyl‐3‐oxidopyridinium. 3‐oxidopyridiniums’ appreciable cycloaddition rates and compatibility with bioorthogonally relevant environments give them the potential to be used in a variety of bioconjugation applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,484
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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