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Enregistrement W4391917498 · doi:10.1089/ten.tea.2023.0321

<sup>13</sup> C Metabolic Flux Analysis in Chondrocytes Reveals a Novel Switch in Metabolic Phenotype

2024· article· en· W4391917498 sur OpenAlexaff
Roberto Tarantino, H. Jensen, Stephen D. Waldman

Notice bibliographique

RevueTissue Engineering Part A · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensToronto Metropolitan UniversityInstitute for Work & HealthSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolic flux analysisCitric acid cycleMetabolic pathwayMetabolismFlux (metallurgy)MetabolomicsMetabolic networkChemistryAnaerobic exerciseBiochemistryCell biologyMetabolomeFermentationPhenotypeMetabolic engineeringBiologyMetaboliteEnzymeChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chondrocytes are typically known for their anaerobic metabolism both in vivo and under culture conditions in vitro. However, chondrocytes have been shown to display greater biosynthetic activity when subjected to conditions that elicit aerobic metabolism. We have previously shown that tissue formation by chondrocytes can be upregulated by controlling nutrient availability and that this response arises from changes in glucose metabolism. The aim of the present study was to further characterize these changes through 13C-metabolic flux analysis (13C-MFA), as well as to determine the most optimal response. Primary bovine chondrocytes were grown in scaffold-free high-density tissue culture. [U-13C] glucose labeling experiments were combined with a tissue-specific metabolic network model to carry out 13C-MFA under varying levels of nutrient availability. 13C-MFA results demonstrated that when subjected to increasing nutrient availability, chondrocytes switch from a predominately anaerobic to a mixed aerobic–anaerobic phenotype. This metabolic switch was attributed to the saturation of the lactate fermentation pathway and metabolite overflow toward the tricarboxylic acid cycle. This effect appears to be similar to, but the inverse of, the Crabtree effect (“inverse Crabtree effect”). The relationships between metabolic flux and nutrient availability were then utilized to identify culture conditions that promote enhanced tissue formation. This novel metabolic effect presents a simple but effective approach for enhancing the biosynthetic response of chondrocytes—a key requirement to develop functional engineered cartilaginous tissue for joint resurfacing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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