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Enregistrement W4392011062 · doi:10.1016/s2589-7500(23)00250-9

Normative modelling of brain morphometry across the lifespan with CentileBrain: algorithm benchmarking and model optimisation

2024· review· en· W4392011062 sur OpenAlexafffund
Ruiyang Ge, Yuetong Yu, Yi Xuan Qi, Yunan Vera Fan, Shiyu Chen, Chuntong Gao, Shalaila S. Haas, Faye New, Henry Brodaty, Rachel M. Brouwer, Randy L. Buckner, Xavier Caseras, Fabrice Crivello, Eveline A. Crone, Susanne Erk, Simon E. Fisher, Barbara Franke, David C Glahn, Udo Dannlowski, Dominik Grotegerd, Oliver Gruber, Hilleke E. Hulshoff Pol, Gunter Schumann, Christian K Tamnes, Henrik Walter, Lara M. Wierenga, Neda Jahanshad, Paul M. Thompson, Sophia Frangou

Notice bibliographique

RevueThe Lancet Digital Health · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFP7 EuratomHORIZON EUROPE Excellent ScienceH2020 Excellent ScienceEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Research ResourcesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute on AgingKnut och Alice Wallenbergs StiftelseNational Cancer InstituteEuropean Research CouncilSeventh Framework ProgrammeRadboud UniversiteitInstituto de Salud Carlos IIIHelse Sør-Øst RHFNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research Council CanadaMedical Research CouncilNational Institutes of HealthHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institute of Mental HealthVetenskapsrådetNorges ForskningsrådInstituto de Investigación Marqués de ValdecillaUniversity of British ColumbiaNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Health and Medical Research CouncilRussian Foundation for Basic ResearchBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute on Drug AbuseIcahn School of Medicine at Mount Sinai
Mots-clésCovariateNormativeBenchmarkingMultivariate statisticsNeuroimagingRobustness (evolution)AlgorithmComputer scienceArtificial intelligenceMachine learningStatisticsMathematicsEconometricsPsychologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The value of normative models in research and clinical practice relies on their robustness and a systematic comparison of different modelling algorithms and parameters; however, this has not been done to date. We aimed to identify the optimal approach for normative modelling of brain morphometric data through systematic empirical benchmarking, by quantifying the accuracy of different algorithms and identifying parameters that optimised model performance. We developed this framework with regional morphometric data from 37 407 healthy individuals (53% female and 47% male; aged 3-90 years) from 87 datasets from Europe, Australia, the USA, South Africa, and east Asia following a comparative evaluation of eight algorithms and multiple covariate combinations pertaining to image acquisition and quality, parcellation software versions, global neuroimaging measures, and longitudinal stability. The multivariate fractional polynomial regression (MFPR) emerged as the preferred algorithm, optimised with non-linear polynomials for age and linear effects of global measures as covariates. The MFPR models showed excellent accuracy across the lifespan and within distinct age-bins and longitudinal stability over a 2-year period. The performance of all MFPR models plateaued at sample sizes exceeding 3000 study participants. This model can inform about the biological and behavioural implications of deviations from typical age-related neuroanatomical changes and support future study designs. The model and scripts described here are freely available through CentileBrain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,065

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,194
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations108
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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