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Enregistrement W4392096926 · doi:10.1038/s41398-024-02811-4

Lithium response in bipolar disorder is associated with focal adhesion and PI3K-Akt networks: a multi-omics replication study

2024· article· en· W4392096926 sur OpenAlexafffund
Anna Ou, Sara Brin Rosenthal, Mazda Adli, Kazufumi Akiyama, Nirmala Akula, Martin Alda, Azmeraw T. Amare, Raffaella Ardau, Bárbara Arias, Jean‐Michel Aubry, Lena Backlund, Michael Bauer, Bernhard T. Baune, Frank Bellivier, Antonio Benabarre, Susanne Bengesser, Abesh Kumar Bhattacharjee, Joanna M. Biernacka, Pablo Cervantes, Guo‐Bo Chen, Hsi‐Chung Chen, Caterina Chillotti, Sven Cichon, Scott R. Clark, Francesc Colom, David A. Cousins, Cristiana Cruceanu, Piotr M. Czerski, Clarissa de Rosalmeida Dantas, Alexandre Dayer, Maria Del Zompo, Franziska Degenhardt, J. Raymond DePaulo, Bruno Étain, Peter Falkai, Frederike T. Fellendorf, Ewa Ferensztajn‐Rochowiak, Andreas J. Forstner, Louise Frisén, Mark A. Frye, Janice M. Fullerton, Sébastien Gard, Julie Garnham, Fernando S. Goes, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Paul Grof, Oliver Gruber, Ryota Hashimoto, Joanna Hauser, Urs Heilbronner, Stefan Herms, Per Hoffmann, Andrea Hofmann, Liping Hou, Stéphane Jamain, Esther Jiménez, Jean‐Pierre Kahn, Layla Kassem, Tadafumi Kato, Sarah Kittel‐Schneider, Barbara König, Po‐Hsiu Kuo, Ichiro Kusumi, Nina Lackner, Gonzalo Laje, Mikael Landén, Catharina Lavebratt, Marion Leboyer, Susan G. Leckband, Carlos López‐Jaramillo, Glenda MacQueen, Mario Maj, Mirko Manchia, Cynthia Marie‐Claire, Lina Martinsson, Manuel Mattheisen, Michael J. McCarthy, Susan L. McElroy, Francis J. McMahon, Philip B. Mitchell, Marina Mitjans, Francis M. Mondimore, Palmiero Monteleone, Caroline M. Nievergelt, Markus M. Nöthen, Tomáš Novák, Urban Ösby, Norio Ozaki, Sergi Papiol, Roy H. Perlis, Claudia Pisanu, James B. Potash, Andrea Pfennig, Daniela Reich‐Erkelenz, Andreas Reif, Eva Z. Reininghaus, Marcella Rietschel, Guy A. Rouleau, Janusz Rybakowski, Martin Schalling, Peter R. Schofield, Klaus Oliver Schubert, Thomas G. Schulze, Barbara Schweizer, Florian Seemüller, Giovanni Severino, Tatyana Shekhtman, Paul D. Shilling, Kazutaka Shimoda, Christian Simhandl, Claire Slaney, Alessio Squassina, Thomas Stamm, Pavla Stopková, Sarah K. Tighe, Alfonso Tortorella, Gustavo Turecki, Eduard Vieta, Julia Volkert, Stephanie H. Witt, Naomi R. Wray, A. Jordan Wright, L. Trevor Young, Peter P. Zandi, John R. Kelsoe

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensUniversity of CalgaryMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteMcGill University Health CentreUniversity of TorontoMontreal Neurological Institute and HospitalDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of Mental HealthNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnUnitatea Executiva pentru Finantarea Invatamantului Superior, a Cercetarii, Dezvoltarii si InovariiMinistry of Education, IndiaVirginia Commonwealth UniversityVetenskapsrådetCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionKarolinska InstitutetMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyBundesministerium für Bildung und ForschungUniversity of California, San DiegoU.S. Department of Veterans AffairsUniversity of New South WalesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversity of OxfordBroad InstituteGenome CanadaAlfried Krupp von Bohlen und Halbach-StiftungNational Institute on Drug AbuseStanley Center for Psychiatric Research, Broad InstituteUniversity of PennsylvaniaUniversidad de AntioquiaDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversity of LouisvilleJohns Hopkins UniversityBrain and Behavior Research FoundationRush UniversityWayne State UniversityNational Science Foundation
Mots-clésPI3K/AKT/mTOR pathwayFocal adhesionProtein kinase BBipolar disorderLithium (medication)Genome-wide association studyPharmacogenomicsSignal transductionBioinformaticsNeuroscienceBiologyMedicineComputational biologyGeneticsSingle-nucleotide polymorphismPsychiatryGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lithium is the gold standard treatment for bipolar disorder (BD). However, its mechanism of action is incompletely understood, and prediction of treatment outcomes is limited. In our previous multi-omics study of the Pharmacogenomics of Bipolar Disorder (PGBD) sample combining transcriptomic and genomic data, we found that focal adhesion, the extracellular matrix (ECM), and PI3K-Akt signaling networks were associated with response to lithium. In this study, we replicated the results of our previous study using network propagation methods in a genome-wide association study of an independent sample of 2039 patients from the International Consortium on Lithium Genetics (ConLiGen) study. We identified functional enrichment in focal adhesion and PI3K-Akt pathways, but we did not find an association with the ECM pathway. Our results suggest that deficits in the neuronal growth cone and PI3K-Akt signaling, but not in ECM proteins, may influence response to lithium in BD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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