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Enregistrement W4392231661 · doi:10.1096/fj.202300978rr

Hydrogen peroxide sensitivity connects the activity of <scp> <i>COX5A</i> </scp> and <scp> <i>NPR3</i> </scp> to the regulation of <scp> <i>YAP1</i> </scp> expression

2024· article· en· W4392231661 sur OpenAlexafffund
Sarah Takallou, Maryam Hajikarimlou, Mustafa Al‐gafari, Jiashu Wang, Sasi Kumar Jagadeesan, Thomas David Daniel Kazmirchuk, Houman Moteshareie, Alex Mulet Indrayanti, Taha Azad, Martin Holčı́k, Bahram Samanfar, Myron L. Smith

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaCarleton UniversityCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de SherbrookeHealth CanadaUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésYAP1Reactive oxygen speciesOxidative stressCell biologyDetoxification (alternative medicine)MitochondrionBiologyGene expressionChemistryGeneBiochemistryTranscription factorMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Reactive oxygen species (ROS) are among the most severe types of cellular stressors with the ability to damage essential cellular biomolecules. Excess levels of ROS are correlated with multiple pathophysiological conditions including neurodegeneration, diabetes, atherosclerosis, and cancer. Failure to regulate the severely imbalanced levels of ROS can ultimately lead to cell death, highlighting the importance of investigating the molecular mechanisms involved in the detoxification procedures that counteract the effects of these compounds in living organisms. One of the most abundant forms of ROS is H 2 O 2 , mainly produced by the electron transport chain in the mitochondria. Numerous genes have been identified as essential to the process of cellular detoxification. Yeast YAP1 , which is homologous to mammalian AP‐1 type transcriptional factors, has a key role in oxidative detoxification by upregulating the expression of antioxidant genes in yeast. The current study reveals novel functions for COX5A and NPR3 in H 2 O 2 ‐induced stress by demonstrating that their deletions result in a sensitive phenotype. Our follow‐up investigations indicate that COX5A and NPR3 regulate the expression of YAP1 through an alternative mode of translation initiation. These novel gene functions expand our understanding of the regulation of gene expression and defense mechanism of yeast against oxidative stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,901

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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