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Enregistrement W4392272790

Integration of planktonic bacteria in the biofilm and functional analysis of the Bthur62720 gene in Bacillus thuringiensis

2021· preprint· en· W4392272790 sur OpenAlexfundno aff
Nay El Khoury

Notice bibliographique

RevueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCampus FranceAgence Universitaire de la Francophonie
Mots-clésBacillus thuringiensisBiofilmBacteriaMicrobiologyBiologyGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacillus thuringiensis is able to produce a pellicle at the air-liquid interface in glass tubes under static conditions. During biofilm formation, two populations coexist: a sessile floating population and a planktonic population, located in the culture medium beneath the pellicle. Using spectrophotometric measurements, we followed the growth of both populations during the B. thuringiensis 407 pellicle formation. Our results show that while the biofilm biomass increases rapidly, the planktonic population growth drops sharply. This decrease is not observed with the 407 spoOA mutant or for strains unable to form a biofilm, and cannot be attributed to cell lysis or cell sedimentation. Therefore, it is the result of a massive integration of planktonic cells in the preformed pellicle. We also visualized, using epi-fluorescence microscopy, the integration of planktonic bacteria of the 407 strain in its preformed biofilm. The recruited cells are located in restricted areas of the biofilm, where the density of sessile cells is low, revealing a heterogeneous spatial distribution of the immigrant cells within the biofilm. To identify the mechanisms involved in the recruitment of planktonic cells in the biofilm, we screened a bank of mutants of the 407 strain, obtained by random mutagenesis, for their ability to integrate a pre-existing biofilm. One of the mutants in the library is strongly affected in its ability to integrate a biofilm. This deficiency is caused by the disruption of the Bthur62720 gene, which is carried by the BTB-9p plasmid and encodes a 21 kDa protein. This protein has no homolog and in silico analysis predict a signal peptide, a N-terminal domain of unknown function and a C-terminal membrane domain. Using immunocytochemistry and translational fusion assays with GFP, we showed that this protein is parietal, polar and that its N-terminal domain is cytoplasmic. With a specific dye of charged membrane phospholipids, 10-N-nonyl acridine orange, we showed that the deletion of Bthur002_62720 disorganizes the lipid rafts distribution, which appear essentially polar in wild type strain 407. Moreover, this deletion strongly affects linear swimming, but not bacterial tumbling or the presence of flagella. These results allow us to hypothesis that Bthur62720 stabilizes the lipid rafts located at the cell poles. The polar localization of these rafts, required for the clustering of chemoreceptors, would be necessary to ensure a normal chemotaxis function and thus, bacterial swimming.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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