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Enregistrement W4392293603 · doi:10.1101/2024.02.28.582602

<i>DVL1</i> variants and C-terminal deletions have differential effects on craniofacial development and WNT signaling

2024· preprint· en· W4392293603 sur OpenAlexafffund
Shruti S. Tophkhane, Sarah J. Gignac, Katherine Fu, Esther M. Verheyen, Joy M. Richman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésWnt signaling pathwayTerminal (telecommunication)CraniofacialDifferential (mechanical device)GeneticsBiologyCell biologySignal transductionComputer scienceTelecommunicationsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Robinow Syndrome (RS) is a rare disease characterized by craniofacial malformations and limb shortening linked with mutations in seven WNT pathway genes. Our objective was to investigate the functional effects of frameshift mutations the intracellular adaptor protein, Dishevelled ( DVL1 ; c.1519 Δ T , p.Trp507Glyfs*142) on chicken craniofacial development. Misexpression of wt (wt) or mutant h DVL1 variants in vivo caused upper beak shortening (wt DVL1 n=8/14; DVL1 1519 Δ T 12/13). At early stages of development, the DVL1 1519 Δ T inhibited frontonasal mass narrowing, chondrogenesis, and proliferation. To test whether the phenotypes were caused due to the abnormal C-terminal peptide in DVL1 1519 Δ T , we designed two additional constructs. The DVL1 1519* (DVL1 507* ) retains first 30 amino acids of the C-terminus while DVL1 1431* (DVL1 477* ) removes the entire C-terminus. DVL1 1519* injected embryos had normal beaks while DVL1 1431* caused high mortality and the phenotypes were like the DVL1 1519 Δ T . In frontonasal micromass cultures, both DVL1 1519 Δ T and DVL1 1431* inhibited skeletogenesis while the DVL1 1519* resembled wt DVL1 and GFP cultures. In luciferase assays DVL1 1519 Δ T , DVL1 1519* and DVL1 1431* weakly activated the WNT canonical and non-canonical JNK-PCP pathways compared to wt DVL1 . Furthermore, we observed that variant DVL1 507*fs is stalled in the nucleus similar to hDVL1 477* , possibly due to the abnormal C-terminus interfering with the nuclear export sequence. wtDVL1 and DVL1 507* were distributed in nucleus and the cytoplasm. Our RS- DVL1 1519ΔT avian model recapitulates the broad face and jaw hypoplasia and demonstrates defects in both branches of WNT signaling. This is the first study to clarify the role of abnormal C-terminus in ADRS and to recognize the importance of an uncharacterized C-terminal sequence. Summary Statement Functional and biochemical studies on chicken embryos with the Robinow syndrome (RS) DVL1 variant demonstrate defects in skeletogenesis and both branches of WNT signaling. This is the first study to establish a link between the RS facial defects and the mutated C-terminal sequence. We identified first 30 amino acids of the DVL1 C-terminus are sufficient for normal development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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