MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4392342344 · doi:10.1101/2024.03.01.582838

O-GlcNAcylation of FOXK1 orchestrates the E2F pathway and promotes oncogenesis

2024· preprint· en· W4392342344 sur OpenAlexafffund
Louis Masclef, Oumaima Ahmed, Nicholas Iannantuono, Jessica K. Gagnon, Mila Gushul-Leclaire, Karine Boulay, Benjamin Estavoyer, Mohamed Echbicheb, Marty Poy, Kalidou Ali Boubacar, Amina Boubekeur, Saad Menggad, Alejandro Schcolnik‐Cabrera, Aurélio Balsalobre, Éric Bonneil, Pierre Thibault, Laura Hulea, Yoshiaki Tanaka, Frédérick Antoine-Mallette, Jacques Drouin, El Bachir Affar

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensInstitute for Research in Immunology and CancerMontreal Clinical Research InstituteUniversité de MontréalCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Centre-Sud-de-l'Île-de-MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, San FranciscoNational Institutes of Health
Mots-clésCarcinogenesisCell biologyE2FCancer researchChemistryBiologyGeneticsTranscription factorCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Gene transcription is a highly regulated process, and deregulation of transcription factors activity underlies numerous pathologies including cancer. Albeit near four decades of studies have established that the E2F pathway is a core transcriptional network that govern cell division in multi-cellular organisms 1,2 , the molecular mechanisms that underlie the functions of E2F transcription factors remain incompletely understood. FOXK1 and FOXK2 transcription factors have recently emerged as important regulators of cell metabolism, autophagy and cell differentiation 3–6 . While both FOXK1 and FOXK2 interact with the histone H2AK119ub deubiquitinase BAP1 and possess many overlapping functions in normal biology, their specific functions as well as deregulation of their transcriptional activity in cancer is less clear and sometimes contradictory 7–13 . Here, we show that elevated expression of FOXK1, but not FOXK2, in primary normal cells promotes transcription of E2F target genes associated with increased proliferation and delayed entry into cellular senescence. FOXK1 expressing cells are highly prone to cellular transformation revealing important oncogenic properties of FOXK1 in tumor initiation. High expression of FOXK1 in patient tumors is also highly correlated with E2F gene expression. Mechanistically, we demonstrate that FOXK1, but not FOXK2, is specifically modified by O-GlcNAcylation. FOXK1 O-GlcNAcylation is modulated during the cell cycle with the highest levels occurring during the time of E2F pathway activation at G1/S. Moreover, loss of FOXK1 O-GlcNAcylation impairs FOXK1 ability to promote cell proliferation, cellular transformation and tumor growth. Mechanistically, expression of FOXK1 O-GlcNAcylation-defective mutants results in reduced recruitment of BAP1 to gene regulatory regions. This event is associated with a concomitant increase in the levels of histone H2AK119ub and a decrease in the levels of H3K4me1, resulting in a transcriptional repressive chromatin environment. Our results define an essential role of O-GlcNAcylation in modulating the functions of FOXK1 in controlling the cell cycle of normal and cancer cells through orchestration of the E2F pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetGlycosylation and Glycoproteins Research→Travaux en français237 207→