Abstract PR006: ARID1A/B mutations retarget mSWI/SNF chromatin remodeler activity and define a spectrum of dedifferentiation in endometrial carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Dedifferentiated/undifferentiated endometrial carcinoma (DEC/UEC) is a highly aggressive histologic subtype of uterine cancer with a higher incidence among non-Hispanic Black women. Recent exome-wide sequencing studies have revealed frequent and often concomitant mutations in the ARID1A and ARID1B genes in over 50% of DEC/UEC cases and 30% of all endometrial carcinomas. The mSWI/SNF family of chromatin remodelers are critical regulators of cell type-specific chromatin accessibility and gene expression, existing in three distinct forms: canonical BAF (cBAF), Poly bromodomain-associated BAF (PBAF), and non-canonical BAF (ncBAF). The paralog subunits, ARID1A and ARID1B, specifically nucleate the assembly of cBAF complexes. However, the precise role ARID1A/ARID1B mutations (cBAF loss) play in the development of dedifferentiated endometrial carcinoma remains unclear. In this study, we define an expression signature associated with endometrial “dedifferentiation” by profiling the well-differentiated and dedifferentiated components of cBAF loss DEC cases through laser capture microdissection followed by RNA sequencing. Introduction of ARID1A or ARID1B in cBAF loss DEC cell lines demonstrated the restoration of cBAF assembly, confirmed by glycerol gradient and IP mass spectrometry. Upon the expression of ARID1A or ARID1B, we observed widespread chromatin occupancy and DNA accessibility at distinct paralog-specific sites, along with common sites associated with epithelial lineage differentiation, estrogen receptor, and PI3K/AKT pathway signaling. These findings align with the differentiation signature, defined in DEC cases demonstrating downregulation of genes associated with Myc targets, cell cycle checkpoint pathways, and DNA repair, suggesting these pathways represent potential therapeutic avenues for targeting DEC/UEC. Collectively, these data establish that well-differentiated endometrial carcinoma and DEC/UEC with mSWI/SNF mutations represent a spectrum of cBAF loss, defining the unique roles of ARID1A and ARID1B in endometrial carcinoma development. Furthermore, these findings imply that cBAF loss drives the widespread changes in DEC morphology, gene expression, and clinical behavior, enhancing our understanding of the etiology and therapeutic options for these cancers. Citation Format: Jessica D. St. Laurent, Grace Xu, Kasey Cervantas, Ajinkya Patil, Akshay Sankar, Shary Chen, David Kolin, Yemin Wang, David G. Huntsman, Cigall Kadoch. ARID1A/B mutations retarget mSWI/SNF chromatin remodeler activity and define a spectrum of dedifferentiation in endometrial carcinoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Endometrial Cancer: Transforming Care through Science; 2023 Nov 16-18; Boston, Massachusetts. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2024;30(5_Suppl):Abstract nr PR006.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».