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Enregistrement W4392631344 · doi:10.1101/2024.03.05.583464

SURVIVIN IN SYNERGY WITH BAF/SWI COMPLEX BINDS BIVALENT CHROMATIN REGIONS AND ACTIVATES DNA DAMAGE RESPONSE IN CD4+ T CELLS

2024· preprint· en· W4392631344 sur OpenAlexaff
Venkataragavan Chandrasekaran, Karin Andersson, Malin C. Erlandsson, Shuxiang Li, María-José García-Bonete, E. Malmhäll-Bah, Pegah Johansson, Gergely Katona, Maria Bokarewa

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesRöntgen-Ångström ClusterStiftelsen Konung Gustaf V:s 80-årsfondGöteborgs UniversitetSahlgrenska UniversitetssjukhusetVetenskapsrådet
Mots-clésSurvivinChromatinH3K4me3DNA damageCancer researchDNA repairCell biologyChemistryHistoneMolecular biologyBivalent chromatinBiologyChromatin remodelingDNAGeneGeneticsGene expressionPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This study explores a regulatory role of oncoprotein survivin on the bivalent regions of chromatin (BvCR) characterized by concomitant deposition of trimethylated lysine of histone H3 at position 4 (H3K4me3) and 27 (H3K27me3). Intersect between BvCR and chromatin sequences bound to survivin demonstrated their co-localization on cis -regulatory elements of genes which execute DNA damage control in primary human CD4 + cells. Survivin anchored BRG1-complex to BvCR to repress DNA damage repair genes in IFNγ-stimulated CD4 + cells. In contrast, survivin inhibition shifted the functional balance of BvCR in favor of H3K4me3, which activated DNA damage recognition and repair. Co-expression of BRG1, survivin and IFNγ in CD4 + cells of patients with rheumatoid arthritis identified arthritogenic BRG1 hi cells abundant in autoimmune synovia. Immunomodulating drugs inhibited the subunits anchoring BRG1-complex to BvCR, which changed the arthritogenic profile. Together, this study demonstrates the function of BvCR in DNA damage control of CD4 + cells offering an epigenetic platform for survivin and BRG1-complex targeting interventions to combat autoimmunity. Summary This study shows that bivalent chromatin regions accommodate survivin which represses DNA repair enzymes in IFNγ-stimulated CD4 + T cells. Survivin anchors BAF/SWI complex to these regions and supports autoimmune profile of T cells, providing novel targets for therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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