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Enregistrement W4392698105 · doi:10.3233/jnd-230216

Improving Diagnostic Precision: Phenotype-Driven Analysis Uncovers a Maternal Mosaicism in an Individual with <i>RYR1</i> -Congenital Myopathy

2024· article· en· W4392698105 sur OpenAlexafffund
Berta Estévez‐Arias, Leslie Matalonga, Loreto Martorell, Anna Codina, C. Ortez, Laura Carrera‐García, J. Expósito, Dèlia Yubero, Janet Hoenicka, Cristina Jou, Francesc Palau, Sergi Beltrán, Hanns Lochmüller, Ana Töpf, A. Nascimento, Daniel Natera‐de Benito

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuromuscular Diseases · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE HealthInstituto de Salud Carlos IIICanadian Institutes of Health ResearchHORIZON EUROPE Framework ProgrammeAgencia Estatal de InvestigaciónCanada Research ChairsCanada First Research Excellence FundEuropean CommissionAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaGovernment of CanadaFundación Ramón Areces
Mots-clésProbandRYR1PhenotypeGeneticsExome sequencingAsymptomaticMyopathyMedicineGenetic testingBiologyMutationPathologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital myopathies (CMs) are rare genetic disorders for which the diagnostic yield does not typically exceed 60% . We performed deep phenotyping, histopathological studies, clinical exome and trio genome sequencing and a phenotype-driven analysis of the genomic data, that led to the molecular diagnosis in a child with CM. We identified a heterozygous variant in RYR1 in the affected child, inherited from her asymptomatic mother. Given the alignment of the clinical and histopathological phenotype with RYR1-CM, we considered the potential existence of a missing second variant in trans in the proband, but also hypothesized that the variant might be mosaic in the mother, as subsequently demonstrated. Our study is an example of how heterozygous variants inherited from asymptomatic parents are frequently dismissed. When the genotype-phenotype correlation is strong, it is recommended to consider a parental mosaicism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,177
Score d'incertitude au seuil0,741

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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