MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392757422 · doi:10.1080/15548627.2024.2319901

International consensus guidelines for the definition, detection, and interpretation of autophagy-dependent ferroptosis

2024· review· en· W4392757422 sur OpenAlexaff
Xin Chen, Andrey S. Tsvetkov, Han‐Ming Shen, Ciro Isidoro, Nicholas T. Ktistakis, Andreas Linkermann, Werner J.H. Koopman, Hans‐Uwe Simon, Lorenzo Galluzzi, Shouqing Luo, Daqian Xu, Wei Gu, Olivier Peulen, Qian Cai, David C. Rubinsztein, Jen‐Tsan Chi, Donna D. Zhang, Changfeng Li, Shinya Toyokuni, Jinbao Liu, Jong‐Lyel Roh, Enyong Dai, Gábor Juhász, Wei Liu, Jianhua Zhang, Minghua Yang, Jiao Liu, Ling‐Qiang Zhu, Weiping Zou, Mauro Piacentini, Wen Y. Ding, Zhenyu Yue, Yangchun Xie, Morten Petersen, David A. Gewirtz, Michael A. Mandell, Charleen T. Chu, Debasish Sinha, Eftekhar Eftekharpour, Boris Zhivotovsky, Sébastien Besteiro, Dmitry I. Gabrilovich, Do‐Hyung Kim, Valerian E. Kagan, Hülya Bayır, Guang‐Chao Chen, Scott Ayton, Jan D. Lünemann, Masaaki Komatsu, Stefan Krautwald, Ben Loos, Eric H. Baehrecke, Jiayi Wang, Jon D. Lane, Junichi Sadoshima, Wan Seok Yang, Minghui Gao, Christian Münz, Michael Thumm, Martin Kampmann, Di Yu, Marta M. Lipinski, Jace W. Jones, Xuejun Jiang, Herbert J. Zeh, Rui Kang, Daniel J. Klionsky, Guido Kroemer, Daolin Tang

Notice bibliographique

RevueAutophagy · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFerroptosis and cancer prognosis
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteLabex Immuno-OncologyBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilInstitut National Du CancerInstitut Universitaire de FranceNational Institute of General Medical SciencesLigue Contre le CancerFondation pour la Recherche MédicaleNational Natural Science Foundation of ChinaAgence Nationale de la RechercheUniversité de ParisSeerave FoundationAssociation pour la Recherche sur le CancerEuropean CommissionCentre National de la Recherche ScientifiqueNational Institutes of HealthEquipex
Mots-clésBiologyAutophagyInterpretation (philosophy)Computational biologyGeneticsComputer scienceApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

: 3-MA:3-methyladenine; 4HNE: 4-hydroxynonenal; ACD: accidentalcell death; ADF: autophagy-dependentferroptosis; ARE: antioxidant response element; BH2:dihydrobiopterin; BH4: tetrahydrobiopterin; BMDMs: bonemarrow-derived macrophages; CMA: chaperone-mediated autophagy; CQ:chloroquine; DAMPs: danger/damage-associated molecular patterns; EMT,epithelial-mesenchymal transition; EPR: electronparamagnetic resonance; ER, endoplasmic reticulum; FRET: Försterresonance energy transfer; GFP: green fluorescent protein;GSH: glutathione;IF: immunofluorescence; IHC: immunohistochemistry; IOP, intraocularpressure; IRI: ischemia-reperfusion injury; LAA: linoleamide alkyne;MDA: malondialdehyde; PGSK: Phen Green™ SK;RCD: regulatedcell death; PUFAs: polyunsaturated fatty acids; RFP: red fluorescentprotein;ROS: reactive oxygen species; TBA: thiobarbituricacid; TBARS: thiobarbituric acid reactive substances; TEM:transmission electron microscopy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,068

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0080,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,125
Tête enseignante GPT0,401
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations176
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAutophagyMême sujetFerroptosis and cancer prognosisTravaux en français237 207