Genetic variation in <i>HIF1A</i> is associated with smoldering inflammation and disease progression in Multiple Sclerosis
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Background Understanding the mechanisms underlying disease progression in Multiple Sclerosis (MS) is fundamental to pave the way to treatment advances. Smoldering demyelinating inflammation characterized by iron deposition is observed at the edges of chronic active lesions and represents a relevant substrate of disease progression in MS. However, the influence of genetic factors on these mechanisms is not known. Leveraging the importance of iron deposition in smoldering inflammation, we assessed whether variants in genes belonging to iron-related pathways affect disease progression in MS. Methods We investigated the association between Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) mapping to 334 genes in iron-related pathways and the risk of disease progression, studying 2,817 MS patients from Italy (n=755) and Sweden (n=2,062), and comparing relapsing-remitting (RR-MS) with secondary progressive (SP-MS) disease course. To better understand the link of the identified variant with smoldering inflammation, we applied a multilayered approach using independent cohorts from Italy, Sweden and the United Kingdom and encompassing gene expression, PRL analysis, neurofilament levels, post-mortem spinal cord pathology and pharmacogenomics. Results We found an association between a locus in the Hypoxia-Inducible Factor 1-alpha ( HIF1A ) gene and the odds of SP-MS transition in the Italian cohort (rs11621525; SP-MS OR 0.57, 95% CI 0.44-0.72; P=3.30×10 - 6 ), which was replicated in the Swedish dataset (rs1951795; OR 0.79, 95% CI 0.67-0.95; P=0.0079). Additional analyses showed that patients carrying the protective allele exhibited reduced HIF1A expression in the immune cells, lower PRL volume, lower plasma/cerebrospinal fluid neurofilament levels, and lower inflammation and acute axonal injury in the post-mortem spinal cord. Moreover, the variant influenced the response to dimethyl fumarate, an approved MS drug with effect on mechanisms shared with HIF1A pathway. Conclusion A novel locus in the HIF1A gene, a crucial hub for iron-binding capacity, inflammation, and hypoxia response, is associated with the risk of disease progression in MS. Converging lines of evidence support the role of this locus in smoldering inflammation, prompting future studies to explore the potential of HIF1A as a therapeutic target in progressive MS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».