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Enregistrement W4392948130 · doi:10.1016/j.breast.2024.103715

Is Oncotype DX testing informative for breast cancers with low ER expression? A retrospective review from a biomarker testing referral center

2024· review· en· W4392948130 sur OpenAlexaff
John Loggie, Penelope J. Barnes, Michael D. Carter, Daniel Rayson, Gillian Bethune

Notice bibliographique

RevueThe Breast · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBreast cancerEstrogen receptorBiomarkerImmunohistochemistryOncologyInternal medicineSingle CenterStainingCancerPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: It remains unclear whether patients with HER2-negative, low-estrogen receptor (ER-low)-positive early breast cancer (BC) benefit from Oncotype DX® (ODX) testing. METHODS: We conducted a retrospective review of cases referred for ODX testing over a seven-year period from a breast biomarker testing referral center (n = 854). For each case, we recorded the ODX Recurrence Score (RS) along with percentage of ER nuclear positivity and staining intensity on immunohistochemistry. Our criteria for ER-low was defined as ≤10% cells with nuclear positivity and/or weak intensity of staining. Slides from all ER-low cases were reviewed and the reported ODX ER gene scores were recorded. We randomly selected a comparator group of 56 patients with ER > 10% positivity and non-weak staining intensity (ER-high). RESULTS: We identified 27 cases (3.2%) that met our criteria for ER-low. Of these, 92.6% had a high RS (>25), and 7.4% had a RS of 25. All cases with ≤10% ER nuclear positivity had a high RS. Most ER-low cases (85.2%) had ODX quantitative ER gene scores in the negative range, whereas all (100%) ER-high cases had positive ER gene scores. CONCLUSION: ODX does not appear to add significant additional information to inform treatment decisions for most patients with ER-low BC. Incorporating weak ER staining intensity in addition to low percentage of nuclear positivity identifies about twice as many ER-low patients, although with reduced specificity for high RS. Our study supports the contention that most ER-low early BC should be regarded similarly to ER-negative BC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,938
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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