MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4392953860 · doi:10.1128/spectrum.00508-24

Genetic and chemical control of tuberculostearic acid production in <i>Mycobacterium avium</i> subspecies <i>paratuberculosis</i>

2024· article· en· W4392953860 sur OpenAlexaff
John P. Bannantine, Shannon C. Duffy, María Alejandra Colombatti Olivieri, Marcel A. Behr, Franck Biet, Neil P. J. Price

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Spectrum · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesAgricultural Research ServiceU.S. Department of Agriculture
Mots-clésMycobacterium avium subspecies paratuberculosisParatuberculosisSubspeciesMycobacteriumMicrobiologyBiologyMycobacterium avium subsp. paratuberculosisMycobacterium avium complexGeneticsBacteriaZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Tuberculostearic acid (TBSA) is a fatty acid unique to mycobacteria and some corynebacteria and has been studied due to its diagnostic value, biofuel properties, and role in membrane dynamics. In this study, we demonstrate that TBSA production can be abrogated either by addition of pivalic acid to mycobacterial growth cultures or by a bfaA gene knockout encoding a flavin adenine dinucleotide (FAD)-binding oxidoreductase. Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis ( Map ) growth and TBSA production were inhibited in 0.5-mg/mL pivalic acid-supplemented cultures, but higher concentrations were needed to have a similar effect in other mycobacteria, including Mycobacterium smegmatis . While Map C-type strains, isolated from cattle and other ruminants, will produce TBSA in the absence of pivalic acid, the S-type Map strains, typically isolated from sheep, do not produce TBSA in any condition. A SAM-dependent methyltransferase encoded by bfaB and FAD-binding oxidoreductase are both required in the two-step biosynthesis of TBSA. However, S-type strains contain a single-nucleotide polymorphism in the bfaA gene, rendering the oxidoreductase enzyme vestigial. This results in the production of an intermediate, termed 10-methylene stearate, which is detected only in S-type strains. Fatty acid methyl ester analysis of a C-type Map bfaA knockout revealed the loss of TBSA production, but the intermediate was present, similar to the S-type strains. Collectively, these results demonstrate the subtle biochemical differences between two primary genetic lineages of Map and other mycobacteria as well as explain the resulting phenotype at the genetic level. These data also suggest that TBSA should not be used as a diagnostic marker for Map . IMPORTANCE Branched-chain fatty acids are a predominant cell wall component among species belonging to the Mycobacterium genus. One of these is TBSA, which is a long-chain middle-branched fatty acid used as a diagnostic marker for Mycobacterium tuberculosis . This fatty acid is also an excellent biolubricant. Control of its production is important for industrial purposes as well as understanding the biology of mycobacteria. In this study, we discovered that a carboxylic acid compound termed pivalic acid inhibits TBSA production in mycobacteria. Furthermore, Map strains from two separate genetic lineages (C-type and S-type) showed differential production of TBSA. Cattle-type strains of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis produce TBSA, while the sheep-type strains do not. This important phenotypic difference is attributed to a single-nucleotide deletion in sheep-type strains of Map . This work sheds further light on the mechanism used by mycobacteria to produce tuberculostearic acid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,749

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobiology SpectrumMême sujetMycobacterium research and diagnosisTravaux en français237 207